转载自：http://blog.csdn.net/hongweigg/article/details/49779943
R语言连接数据库常用的方法有2种：
1、使用R数据库接口
连接MySQL，使用RMySQL包，使用前RMySQL包要先安装。
library(RMySQL)
连接方式有2种：
（1）使用dbConnect
conn <- dbConnect(MySQL(), dbname = "rmysql", username="rmysql", password="rmysql", host="127.0.0.1", port=3306)
数据操作方法：
dbWriteTable(conn, "tablename", data) #写表
dbReadTable(conn, "tablename") #读表
dbDisconnect(conn) #关闭连接
（2）使用sqldf包
首先要安装sqldf包，其次调用：
>library(sqldf)
> sqldf("select * from t_data",dbname="test",drv="MySQL",user="root",password="",host="127.0.0.1",port=3306)
连接后，SQL查询语句后面的参数均可省略，例如：
> sqldf("select * from t_data limit 0,10")
2、使用ODBC连接
在Windows下配置ODBC（开放数据库连接），具体步骤如下：
（1）R下载RODBC包，安装好。
（2）在http://dev.mysql.com/downloads/connector/odbc下载mySQL ODBC，安装好。
（3）Windows：控制面板->管理工具->数据源（ODBC）->双击->添加->选中mysqlODBC driver一项
填写：data source name 一项填入你要使用的名字，自己随便命名，例如：mysql_data;
description一项随意填写，例如mydata
TCP/IP Server 填写本机服务器IP，一般为：127.0.0.1
user 填写你的mysql用户名
password 填写你的mysql密码
然后数据库里会出现你的mysql里的所有数据库，选择一个数据库。
确定。
（4）打开R的界面调用数据库：
library(RODBC);
channel <- odbcConnect("mysql_data", uid="root", pwd="123");
sqlTables(channel);#查看数据中的表
data<-sqlFetch(channel,"kegg")# 查看表的内容，存到数据框里
参考文章：
1、R语言连接Mysql数据库的步骤及简单使用mysql数据库中的数据（学习笔记）.http://www.dataguru.cn/thread-289411-1-1.html
2、R语言连接mySQL数据库步骤. http://blog.sina.com.cn/s/blog_ab3fbf1b0101komj.html
3、R连接MySQL数据库方法备忘. http://www.r-bloggers.com/lang/chinese/1247