参考：http://www.manew.com/thread-99292-1-1.html
1. 隐藏文件夹
以.开头的文件夹会被忽略。在这种文件夹中的资源不会被导入，脚本不会被编译。也不会出现在Project视图中。这种文件我们可以在资源浏览器的时候，能找到这些文件。
2. Standard Assets
在这个文件夹中的脚本最先被编译。一般是放一些Unity 内置的一些资源。
这个文件夹中的脚本会被导出到Assembly-CSharp-firstpass, Assembly-UnityScript-firstpass 或 Assembly-Boo-firstpass项目中，依语言而定。
官方文档：http://docs.unity3d.com/Documentation/Manual/ScriptCompileOrderFolders.html
在这个文件夹中的脚本比其他脚本都要先编译。将脚本放在这个文件夹里，就可以用C#脚本来访问js脚本或其他语言的脚本。
3. Pro Standard Assets
和Standard Assets相同，只不过里面的文件是给Pro版本的Unity使用的。当然它的功能更为的丰富，例如一些高级内置的shader文件，只有在Pro版才能起作用。
4. Editor
以Editor命名的文件夹允许其中的脚本访问Unity Editor的API。如果脚本中使用了在UnityEditor命名空间中的类或方法，它必须被放在名为Editor的文件夹中。Editor文件夹中的脚本不会在build时被包含。
在项目中可以有多个Editor文件夹。［注意：如果在普通的文件夹下，Editor文件夹可以处于目录的任何层级。如果在特殊文件夹下，那Editor文件夹必须是特殊文件夹的直接子目录。］
5. Editor Default Resources
你可以把编辑器用到的一些资源放在这里，比如图片、文本文件、等等。它和Editor文件夹一样都不会被打到最终发布包里，仅仅用于开发时使用。你可以直接通过EditorGUIUtility.Load去读取该文件夹下的资源，例如：
TextAsset text = EditorGUIUtility.Load(“1.txt")as TextAsset;
6. Plugins
Plugins文件夹用来放native插件。它们会被自动包含进build中去。注意这个文件夹只能是Assets文件夹的直接子目录。
例如：Windows：dll文件；
Mac OS X：bundle文件；
Linux下：.so文件。
和Standard Assets一样，这里的脚本会更早的编译，并且允许它们被之外的脚本访问。
6.0. Plugins/x86 || x86_64 (一般PC平台)
如果为32bit或64bit平台创建游戏，那么这个文件夹下的native plugin文件会被自动的包含在游戏build中。如果这个文件夹不存在，则Unity会查找Plugins文件夹下的native pluglins。
如果要创建universal build，建议你同时使用这两个文件夹。然后将32bit和64bit的native plugins放进相应的文件夹中。
6.1. Plugins/android
在这个文件夹里放入Java.jar文件。用于java语言的plugins。.so文件也会被包含进来。
官方文档：http://docs.unity3d.com/Documentation/Manual/PluginsFor.html
6.2. Plugins/iOS
在这个文件夹放入.o、.m 、 .mm 、.c 、.cpp等文件，一般在IOS 平台导出对应的文件。
官方文档：http://docs.unity3d.com/Documentation/Manual/PluginsForIOS.html
7. Resources
Resources文件夹允许你在脚本中通过文件路径和名称来访问资源。放在这一文件夹的资源永远被包含进build中，即使它没有被使用。因为Unity无法判断脚本有没有访问了其中的资源。项目中可以有多个Resources文件夹，因此不建议在多个文件夹中放同名的资源。一旦build游戏，Resources文件夹中的所有资源被打包进游戏存放资源的archive中。这样在游戏的build中就不存在Resources文件夹了。即使脚本中仍然使用了资源在项目中的路径。
官方文档：http://docs.unity3d.com/Documentation/Manual/LoadingResourcesatRuntime.html
注意：当资源作为脚本变量被访问时，这些资源在脚本被实例化后就被加载进内存。如果资源太大，你可能不希望它被这样加载。那么你可以将这些大资源放进Resources文件夹中，通过Resources.Load来加载。当不再使用这些资源了，可以通过Destroy物体，再调用Resources.UnloadUnusedAssets来释放内存。
特点：
(1).文件夹内资源打包集成.asset 文件里面，例如一些shader／material/prefab等资源文件;
(2).里面的资源只能是只读，不能动态修改，一般动态的更新的资源不雅放在这个文件夹内;
(3).通过主线程加载；
(4). Resources.Load ();加载资源
Resources.LoadAll ();加载所有资源
Resources.LoadAsync ();异步加载资源
8. Gizmos
Gizmos文件夹存放用Gizmos.DrawIcon方法使用的贴图、图标资源。放在Gizmos文件夹中的贴图资源可以直接通过名称使用，可以被Editor作为gizmo画在屏幕上。这里还是要说说OnDrawGizmos()方法，只要脚本继承了MonoBehaviour后，并且在编辑模式下就会每一帧都执行它。发布的游戏肯定就不会执行了，它只能用于在scene视图中绘制一些小物件。比如要做摄像机轨迹，那么肯定是要在Scene视图中做一个预览的线，那么用Gizmos.DrawLine 和Gizmos.DrawFrustum就再好不过了。
9. WebPlayerTemplates
用来替换web build的默认网页。这个文件夹中的脚本都不会被编译。这个文件夹必须作为Assets文件夹的直接子目录。
10. StreamingAssets
这里的文件会被拷贝到build文件夹中，不会修改（移动和网页版不同，他们会被嵌入到最终build文件中）。它们的路径会因平台而有差异，但都可以通过Application.streamingAssetsPath来访问。
例如：有些游戏为了让所有的资源全部使用assetbundle，会把一些初始的assetbundle放在StreamingAssets目录下,StreamingAssets目录下的资源都是不压缩的，而且它比较大会占空间 <ignore_js_op>