ABySS 拼接工具

ABySS, that stands for Assembly By Short Sequences, is a de novo, parallel, paired-end sequence assembler that is designed for short reads. The single-processor version is useful for assembling genomes up to 100 Mbases in size. The parallel version is implemented using MPI and is capable of assembling larger genomes.

原始论文：http://genome.cshlp.org/content/19/6/1117

主页：http://www.bcgsc.ca/platform/bioinfo/software/abyss

时间： 2024-12-05 12:31:07

ABySS 拼接工具的相关文章

根据表结构自动生成JavaBean，史上最强最专业的表结构转JavaBean的工具(第11版)

目录: 第1版:http://blog.csdn.net/vipbooks/article/details/51912143 第2版:http://blog.csdn.net/vipbooks/article/details/51912537 第3版:http://blog.csdn.net/vipbooks/article/details/51912750 第4版:http://blog.csdn.net/vipbooks/article/details/51912930 第5版:http:/

.NET破解之google瓦片下载及拼接

由于最近一些其他事忙,加之电脑显卡坏了,所以,好长一段时间没有更新博客了,感觉对不注关注我的朋友.从本文开始,博客更新频率将会大大降低,但每周都会更新的. 在上帝之眼论坛看到了新出来了一个google瓦片下载及拼接工具,看起来不错,这是第一次看到没有视图窗口的地图下载器,还没测试过功能,查壳是.NET写的,于是准备来看看. 1.试用程序试用程序的目的,一方面是熟悉软件的使用,进一步了解软件,另一方面,也更重要,看它的限制点有哪些,是什么.这往往是为下一步甚至整个过程打下基础.比如这个程序,打开

做一个合格的前端，gulp自动化构建工具入门教程

我的新作观点网http://www.guandn.com (观点网是一个猎获新奇.收获知识.重在独立思考的网站),它前端js.css的压缩.合并.md5命名等就使用了gulp自动化构建技术,gulp很小巧使用起来很舒服.ps:接下来我会逐一开源观点网开发过程中的前后端技术,如:lucene全文索引.自定义富文本编辑器.图片上传压缩水印等等. 一.什么是gulp gulp是一个自动化构建工具,开发者可以使用它在项目开发过程中自动执行常见任务.例如:css.js的合并与压缩(减少http请求,缩小文

paired-end reads的拼接

paired-end reads的拼接发表于2012 年 8 月 13 日 Velvet中paired-end reads的拼接文件格式要将两头测序(paired-end)的reads放到同一个文件当中,fastq格式,必须成对的依次放置reads [interleaved],velvet是成对读取的,另外Velvet假设来自两头read是反向互补的,如果不是,需要用反向互补序列来代替第一个read.Fastq格式中paired-end reads的编号相同,但是其有/1或者/2的后缀,通

第三十四节（java-实现在线翻译）

NameValue .java文件里: package com.tanzhou.util; /** * 参数拼接工具类 * @author Ming * @version 1.0 * 2015-2-7 */ public class NameValue { // &client=t&hl=zh-CN&ie=UTF-8&multires=1&oe=UTF-8&otf=1&prev=conf&psl=zh-CN&ptl=zh-CN&

图片搜索的原理

http://www.zhihu.com/question/19726630 Google 图片搜索的原理是什么? 1 条评论分享按投票排序按时间排序 18 个回答 389赞同反对,不会显示你的姓名知乎用户,安全行业 XsXs.知乎用户.知乎用户等人赞同针对这个问题,请教了算法组的同事,他分享了基本的思路: 对于这种图像搜索的算法,一般是三个步骤: 1. 将目标图片进行特征提取,描述图像的算法很多,用的比较多的是:SIFT描述子,指纹算法函数,bundling features算法,h

程序员的自我救赎---1.4.1：核心框架讲解(DAL)

<前言> <目录> (一) Winner2.0 框架基础分析 (二) 短信中心 (三)SSO单点登录 (四)PLSQL报表系统 (五)钱包系统 (六)GPU支付中心 (七)权限系统 (八)监控系统 (九)会员中心 (十)消息中心 (十一)Winner前端框架与RPC接口规范讲解 (十二)上层应用案例 (十三)番外篇 <核心框架讲解> 之前在<Winner2.0框架解决方案命分层规范> 有讲到过Winner框架最重要的三个程序集分别是: Winner.Fram

中科院生物信息学题目整理

1.什么是生物信息学,如何理解其含义? 答:生物信息学有三个方面的含义: 1) 生物信息学是一个学科领域,包含着基因组信息的获取.处理.存储.分配 .分析和解释的所有方面. 2) 生物信息学是把基因组DNA序列信息分析作为源头,破译隐藏在DNA序列中的遗传语言,特别是非编码区的实质:同时在发现了新基因信息之后进行蛋白质空间结构模拟和预测:其本质是识别基因信号. 3) 生物信息学的研究目标是揭示"基因组信息结构的复杂性及遗传语言的根本规律"

基于Dapper的开源Lambda超轻量扩展，Dapper.Common

Dapper.Common Dapper.Common是基于Dapper的Lambda扩展,遵循Linq语法规则,上手快,支持Mysql,Sqlserver(目前只实现了这两个数据,实现其他数据库也很轻松),支持单表,多表,自定义函数等功能. 开源地址:https://github.com/1448376744/Dapper.Common Nuget:Install-Package Dapper.Common -Version 1.5.0 1.Mapper public class User {