minGW与cygwin
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首先MingW和cygwin都可以用来跨平台开发。
MinGW是Minimalistic GNU for Windows的缩写，也就是Win版的 精简的GCC 。
MinGW 收集了一系列免费的Windows 使用的头文件和库文件；同时整合了GNU( http://www.gnu.org/ )的工具集，特别是GNU 程序开发工具，如经典gcc, g++, make等。
Microsoft的有一套unix的子系统的开发环境，不过只是一个posix子集，linux的许多函数不能用，当然fork没问题。
Cygwin则是 全面模拟 了Linux的接口，提供给运行在它上面的的程序使用，并提供了大量现成的软件，更像是一个平台。
相对的MingW也有一个叫MSYS（Minimal system）的子项目，主要是提供了一个模拟Linux的Shell和一些基本的Linux工具。因为编译一个大型程序，光靠一个GCC是不够的，还需要有Autoconf等工具来配置项目，所以一般在Windows下编译Linux下的大型项目都是通过MSYS来完成的，当然MSYS只是一个辅助环境，根本的工作还是MingW来做的。
用MingW和cygwin编译出来的程序的区别
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首先，MingW和cygwin都不能让Linux下的程序直接运行在Windows上，必需通过源代码重新编译。
现代操作系统包括Windows和Linux的基本设计概念像进程线程地址空间虚拟内存这些都是大同小异的，之所以二者上的程序不能兼容，主要是它们对这些功能具体实现上的差异，
首先是可执行文件的格式，Window使用PE的格式，并且要求以.EXE为后缀名。Linux则使用ELF。
其次，操作系统的API也不一样，如Windows用CreateProcess()创建进程，而Linux使用fork()。
所以要移植程序必然要在这些地方进行改变，
MinGW的方案：
来把代码中Linux下的系统调用API直接 替换 修改成对应的Windows下的API。所以生成的执行文件已经 看不到linux的系统调用api 。
Cygwin方案：
Cygwin通过 cygwin1.dll 这个动态库 实现两个平台API的转换 。Cygwin生成的程序依然有fork()这样的Linux系统调用API， 只不过在cygwin1.dll实现到Windows功能的转换。
用Mingw编译的程序性能会高一点，而且也不用带着那个接近两兆的cygwin1.dll文件。
【综上所述】
1.修改编译器,让window下的编译器把诸如fork的调用翻译成等价的形式--这就是mingw的做法.
2.修改库,让window提供一个类似unix提供的库,他们对程序的接口如同unix一样,而这些库,当然是由win32的API实现的--这就是cygwin的做法.