FFT字符串匹配

本文半原创

参考资料:其实就是照抄的什么参考啊

我们知道KMP可以用来在线性复杂度内进行制胡窜匹配

今天教您一种新方法:用FFT进行字符串匹配

您可能觉得这很玄学,FFT不是做多项式卷积的吗,怎么还可以做制胡窜匹配

您先别着急,请接着听

我们设两个字符串--模式串\(a\),长度为\(m\),文本串\(b\),长度为\(n\)。设下标为从0开始

定义函数\(a(i)\)返回a串位置i的字符,\(b(i)\)返回b串位置i的字符(其实就是下标)

定义匹配函数\(c(x,y)=a(x)-b(y)\),代表a串x位置和b串y位置是否匹配(也就是是否相同)

如果匹配,那么\(c(x,y)=0\)对吧

然后我们再定义完全匹配函数\(\displaystyle P(x)=\sum_{i=0}^{m-1}c(i,x-m+i+1)\),若\(P(x)=0\),则称B以第\(x\)位结束的连续\(m\)位与A完全匹配

但是这个匹配函数是有问题的

他会导致字符串"ab"和字符串"ba"匹配,你想想是不是,一个-1一个1,加起来就是0喽

所以我们稍微改一下匹配函数:\(c(x,y)=(a(x)-b(y))^2\),保证\(c(x,y)\ge 0\),这样是不是就没问题了啊

所以我们的\(\displaystyle P(x)=\sum_{i=0}^{m-1}(a(i)-b(x-m+i+1))^2\)

您还没有看出什么玄机来

我们可以把\(a\)串翻转,设翻转后的串为\(s\),则满足\(a(i)=s(m-i-1)\)对吧,下标是从0开始的

所以我们的\(\displaystyle P(x)=\sum_{i=0}^{m-1}(s(m-i-1)-b(x-m+i+1))^2\)

继续观察!发现什么了???要不我们换一下元,用\(i\)替换\(m-i+1\),注意其中\(i\)的范围由\([0,m-1]\)变换到了\([0,m-1]\)你直接说没有变不就得了

所以我们的\(\displaystyle P(x)=\sum_{i=0}^{m-1}(s(i)-b(x-i))^2\)

要不我们把完全平方展开下

所以我们的\(\displaystyle P(x)=\sum_{i=0}^{m-1}(s^2(i)-2s(i)b(x-i)+b^2(x-i))\)

拆一下sigma

所以我们的\(\displaystyle P(x)=\sum_{i=0}^{m-1}s^2(i)+\sum_{i=0}^{m-1}b^2(x-i)-2\sum_{i=0}^{m-1}s(i)b(x-i)\)

这式子是不是不错啊

第一项是个定值,可以直接算出啦

第二项,由于加的是一段区间,可以O(n)预处理前缀和

第三项!!!这是什么?不就是我们的卷积吗

FFT即可

时间复杂度O(nlogn)

诶对了

到了这里您可能会发现这个时间复杂度都没KMP优秀

您可能会问我这个算法有个吊毛用啊,FFT还没KMP好写(FFT其实也挺好写的)

别急听我接着讲

如果我们的字符串里有通配符呢

就是说这个通配符跟什么字符匹配都行(注意是字符而不是字符串)

您会发现KMP就GG了

然后我们继续考虑FFT做法

这次我们强制令通配符的ascii为0

定义我们的匹配函数\(c(x,y)=(a(x)-b(y))^2a(x)b(y)\),那么是不是对于有通配符的都能保证\(c=0\)了呢

然后就是推一波式子的事情了

大家可以试着推推

行了下面是结果

所以我们的\(\displaystyle P(x)=\sum_{i=0}^{m-1}(s^3(i)b(x-i)-2s^2(i)b^2(x-i)+s(i)b^3(x-i))\)

我们对\(s,s^2,s^3,b,b^2,b^3\)进行FFT,然后再DFT回来就行啦

例题

有了这个算法之后不就是板子题啦

例题

这题可以用SAM做,@顾z

好像还可以用哈希做。。。还是@顾z

温馨提示:根据生物学知识,人类DNA上的碱基只有四种

大家可以想一想正解

我们对ATCG贡献分开算,这里的贡献指的是不匹配的字符数

假设我们当前强行只计算模式串中A对于匹配串的贡献

先把模式串翻转一下

那么我们把模式串的A当做1,T C G都当做0,把文本串的A当做0,T C G都当做1

然后直接让模式串和文本串卷积(数字很小,可以用NTT优化卷积)

累加的贡献就是A与TCG不匹配的

最后把所有<=3的位置统计即为答案

总结:

这种带通配符/不匹配的字符串题我们一般是构造关于字符串的函数,对某个字符串翻转,然后进行卷积再各种处理。

这种题只是FFT的一种应用。

原文地址:https://www.cnblogs.com/oier/p/10066781.html

时间: 2024-10-16 00:27:07

FFT字符串匹配的相关文章

uva:10340 - All in All(字符串匹配)

题目:10340 - All in All 题目大意:给出字符串s和t,问s是否是t的子串.s若去掉某些字符能和t一样,那么t是s的子串. 解题思路:匹配字符.t的每个字符和s中的字符匹配.注意这里的字符数组大小要开大点. 代码: #include <stdio.h> #include <string.h> const int N = 1000005; char s[N], t[N]; bool match () { int i = 0; int lens = strlen(s);

CCF 字符串匹配

问题描述 试题编号: 201409-3 试题名称: 字符串匹配 时间限制: 1.0s 内存限制: 256.0MB 问题描述: 问题描述 给出一个字符串和多行文字,在这些文字中找到字符串出现的那些行.你的程序还需支持大小写敏感选项:当选项打开时,表示同一个字母的大写和小写看作不同的字符:当选项关闭时,表示同一个字母的大写和小写看作相同的字符. 输入格式 输入的第一行包含一个字符串S,由大小写英文字母组成. 第二行包含一个数字,表示大小写敏感的选项,当数字为0时表示大小写不敏感,当数字为1时表示大小

字符串匹配的KMP算法

html, body { font-size: 15px; } body { font-family: Helvetica, "Hiragino Sans GB", 微软雅黑, "Microsoft YaHei UI", SimSun, SimHei, arial, sans-serif; line-height: 1.6; color: ; background-color: ; margin: 0; padding: 16px 20px; } h1, h2, h

字符串匹配与KMP算法笔记

>>字符串匹配问题 字符串匹配问题即在匹配串中寻找模式串是否出现, 首先想到的是使用暴力破解,也就是Brute Force(BF或蛮力搜索) 算法,将匹配串和模式串左对齐,然后从左向右一个一个进行比较, 如果不成功则模式串向右移动一个单位,直到匹配成功或者到达匹配串最后仍然不成功,返回失败. 很明显,这种算法有很多的地方可以优化,假设要搜索的串为S,长度为n,要匹配的串为M,长度为m,时间复杂度为O(nm). >>KMP算法 Knuth-Morris-Pratt算法以三个发明者命名

KMP算法解决字符串匹配

该算法由D.E.Knuth ,J.H.Morris和 V.R.Pratt提出,用于解决字符串匹配问题. 思想: 设目标串(主串)为s,模式串为t ,并设i指针和j指针分别指示目标串和模式串中正待比较的字符,设i和j的初值均为0.若有s[i]=t[j],则i和j分别加1.否则,i不变,j退回到j=next[j-1]的位置,再比较s[i]和t[j],若相等,则i和j分别加1.否则,i不变,j再次退回到j=next[j]的位置,依此类推.直到下列两种可能: 1. 模式串t中的字符全部匹配,则出现频率+

字符串匹配 【kmp】

字符串匹配 Time Limit: 1 Sec Memory Limit: 128 MB Submit: 214 Solved: 81 Description 给你两个字符串A,B,请输出B字符串在A字符串中出现了几次. Input 多组测试数据,每组输入两个字符串.字符串的长度 <= 1000000. Output 输出B在A中出现的次数. Sample Input aaa aa Sample Output 1 子串在母串中出现的次数,串不重叠 #include <stdio.h> #

九度机试 题目1165:字符串匹配 2008年北京航空航天大学计算机研究生机试真题

题目1165:字符串匹配 时间限制:1 秒 内存限制:32 兆 特殊判题:否 提交:2497 解决:858 题目描述: 读入数据string[ ],然后读入一个短字符串.要求查找string[ ]中和短字符串的所有匹配,输出行号.匹配字符串.匹配时不区分大小写,并且可以有一个用中括号表示的模式匹配.如"aa[123]bb",就是说aa1bb.aa2bb.aa3bb都算匹配. 输入: 输入有多组数据. 每组数据第一行输入n(1<=n<=1000),从第二行开始输入n个字符串(

字符串匹配问题

.字符串匹配问题 [问题描述] 字符串中只含有括号 (),[],<>,{},判断输入的字符串中括号是否匹配.如果括号有互相包含的形式,从内到外必须是<>,(),[],{},例如.输入: [()] 输出:YES,而输入([]), ([])都应该输出NO. [输入格式]strs.in 文件的第一行为一个整数n,表示以下有多少个由括好组成的字符串.接下来的n行,每行都是一个由括号组成的长度不超过255的字符串. [输出格式]strs.out 在输出文件中有N行,每行都是YES或NO. [

【Foreign】字符串匹配 [KMP]

字符串匹配 Time Limit: 10 Sec  Memory Limit: 256 MB Description Input Output Sample Input 3 3 6 3 1 2 1 2 3 2 3 1 3 6 3 1 2 1 2 1 2 3 1 3 6 3 1 1 2 1 2 1 3 1 3 Sample Output 3 1 2 4 4 1 2 3 4 3 2 3 4 HINT Source 发现题目中颜色的具体权值是对答案无关的,然后就是只要相对位置一样即可. 那么显然是一个