转载自：http://blog.csdn.net/zhouxicai/article/details/8365338
解决方案1:
原来机器上安装了VS2010非常正常，安装VS2012后，出现提示
错误 13 error LNK1123: 转换到 COFF 期间失败: 文件无效或损坏，如图：
出现的具体原因是微软的链接文件的格式变了（让人无语的微软）
微软官方给出的具体解决方法是给VS2010打SP1补丁。
下载地址是：http://www.microsoft.com/en-us/download/details.aspx?id=23691
解决方案2:
是嵌入清单的问题，于是对该工程以及所有依赖工程进行如下操作
右键->工程属性->配置属性-> 清单工具->输入和输出->嵌入清单，选择[否]
1>LINK : fatal error LNK1123: 转换到 COFF 期间失败: 文件无效或损坏
1>CVTRES : fatal error CVT1100: 资源重复。类型: MANIFEST，名称: 1，语言: 0x0409
这个是由于日志文件引起的，可以将
项目\属性\配置属性\清单工具\输入和输出\嵌入清单：原来是“是”，改成“否”。
或者将
项目\属性\配置属性\链接器\清单文件\生成清单：原来是“是”，改成“否”。
我总结了下这个效果的处置方法：
1：假设名目是一个静态库，或许说，名目中没有本质的资源文件的时候，将嵌入清单改成“否”是可能处置的。
2：假设名目已有了资源文件，将嵌入清单改成“否”是不行能处置效果的，除非你同时把这些资源文件移除掉。
论断，确保名目中没有资源文件的存在，且把嵌入清单改成“否”可能处置该效果，但这确实也失掉了资源文件的作用，没措施，谁让他是个Bug呢。
解决方案3:
November 28, 2012, 16:31 Posted by Posted in [Channel 8]
Visual Studio 2012发布一段时间了，使用起来感觉也不错。但是最近写一个小程序却遇到了比较麻烦的事情。
这个程序是使用Visual Studio 2012编写的MFC应用程序，编译后一直在Win7系统中Debug和运行，一切都正常。但是放到XP或2003等系统中运行就会提示“not a valid win32 application”。一开始以为文件损坏了，后来copy几次发现问题依旧。
然后搜索，发现有很多人提到了这个问题，主要是由于VS2012的原因，编译的程序不再支持XP了。不过MS官方也提到将发布一个补丁解决此问题。最初该补丁是包含在Visual Studio 2012 update 1 CTP 3中。搜索这个包发现已经不存在，后来才发现，在26号（也就是1天多之前）的时候已经发布了Visual Studio 2012 update 1的正式版，于是下载安装。
按照官方给出的提示，安装成功之后，打开VS2012，在项目上属性中，应该会存在配置属性-常规-平台工具集中出现“Visual Studio 2012 (v110 XP)”。非常遗憾的是这个Update 1的包是在线安装的，总是有一个包下载不下来，安装几次也无济于事。
无奈之下重新安装了一个Visual Studio 2010，不过将原来的工程再转为2010的工程就太麻烦了。好在这个时候从2012中再看工程的属性时，平台工具集中已经出现“Visual Studio 2010 (v100)”和“Visual Studio 2008 (v90)”了。于是重新生成工程，编译，然后就又出了问题。
这时遇到的问题是“LINK : fatalerrorLNK1123:转换到COFF期间失败: 文件无效或损坏”。继续搜索，发现这个问题也很常见，处理方法也比较一致，就是继续设置工程的属性，配置属性-清单工具-输入和输出-嵌入清单-否。
按照这个方法设置之后发现依旧不好用，可是貌似网上其他人都用此方法解决了问题啊，奇怪。后来突然发现系统右下角出现了Visual Studio 2010 sp1补丁的安装通知。想着可能以后还要用2010，于是拿以前下载好的sp1安装包安装。然后再次尝试，惊喜地发现问题居然解决了，终于编译出了可以在XP和2003中运行的MFC程序。
总结一下，就是安装VS 2010及其SP1，设置属性的嵌入清单为否，平台工具集为2010，重新生成即可。
其实这个也就是临时急着解决问题用的，估计过几天VS2012 update 1的网络安装稳定了，就可以直接使用2012的工具集编译出支持XP和2003的程序了。
解决方案4：
微软的东西就是这样，一旦出了问题，你只能选择重装，甚至是重装系统。我也采用这种笨方案。不过凭感觉可能与我以前在D盘安装过vc有关，有可能覆盖安装导致某些文件被破坏。于是我先卸载了VC，然后把文件夹D:/program files/Viusaul studios删除掉，以前就是安装的这个目录。然后重启电脑，重新安装了一下。又重新打开小项目，编译，通过了。
总结： 这些方法是从网上搜来整理的，经过我测试，方法2会起作用，但是我测试的三个项目，有一个项目始终不行，用方案1下载一个sp1包（约600M），安装后，重启，打开VS按照vs的弹出框提示安装其他补丁后，重新编译，问题解决！