基于K-Nearest Neighbors[K-NN]算法的鸢尾花分类问题解决方案(For Python)

  看了原理,总觉得需要用具体问题实现一下机器学习算法的模型,才算学习深刻。而写此博文的目的是,网上关于K-NN解决此问题的博文很多,但大都是调用Python高级库实现,尤其不利于初级学习者本人对模型的理解和工程实践能力的提升,也不利于Python初学者实现该模型。

  本博文的特点:

    一 全面性地总结K-NN模型的特征、用途

    二  基于Python的内置模块,不调用任何第三方库实现

  博文主要分为三部分:

    基本模型(便于理清概念、回顾模型)

    对待解决问题的重述

    模型(算法)和评价(一来,以便了解模型特点,为以后举一反三地应用作铺垫;二来,有利于以后快速复习)、

    编程实现(Code)。

  特别声明:

    1.劳动成果,未经同意博主(千千寰宇:http://cnblogs.com/johnnyzen),不得以任何形式转载、复制。

    2.如有纰漏或者其他看法,欢迎共同探讨~

零 基本模型

  (本部分内容,均来源于引用[1],其原理讲解十分通俗易懂)

  ①K-近邻算法,即K-Nearest Neighbor algorithm,简称K-NN算法。单从名字来猜想,可以简单粗暴的认为是:K个最近的邻居,当K=1时,算法便成了最近邻算法,即寻找最近的那个邻居。

  ②所谓K-NN算法,即是给定一个训练数据集,对新的输入实例,在训练数据集中找到与该实例最邻近的K个实例(也就是K个邻居), 这K个实例的多数属于某个类,就把该输入实例分类到这个类中。

  ③实例

    猜猜看:有一个未知形状(绿色圆点),如何判断其是什么形状?

    问题:给这个绿色的圆分类?

    对噪声数据过于敏感。为了解决这个问题,我们可以把位置样本周边的多个最近样本计算在内,扩大参与决策的样本量,以避免个别数据直接决定决策结果。

    有两类不同的样本数据,分别用蓝色的小正方形和红色的小三角形表示,而图正中间的那个绿色的圆所标示的数据则是待分类的数据。

    如果K=3,判定绿色的这个待分类点属于红色的三角形一类。

    如果K=5,判定绿色的这个待分类点属于蓝色的正方形一类。

一 问题

  题目:ML之k-NN:k-NN实现对150朵共三种花的实例的萼片长度、宽,花瓣长、宽数据统计,根据一朵新花的四个特征来预测其种类
  数据源:https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.data
  数据源说明:https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.names

二 解决过程及模型评价

  一 审题/准备数据集

    1.1 明确问题基本模型,及涉及要素(特征值、有无标记、可考虑的基本算法模型):K-NN、分类、监督学习、有标记、鸢尾花分类

    1.2 准备数据集及其处理方法

      数据源:https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.data

      数据源说明:https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.names

  二 分析并设计解决思路(算法步骤)

    2.0 零 样本及样本空间、测试空间的程序表示

        设计样本的class类:Iris(鸢尾花类):

          便于将样本空间以数组化表示 + 便于后期训练对各样本的取值、标记、比对等操作

    2.1 一 读取数据集,装载样本集

        提取文件数据至计算机进程(程序)中,并恰当地表示样本、样本集、测试集

      文件I/O操作:

        open(filepath+filename,mode)、

        file.readline()、

        file.readlines()、

        file.next()、

      字符串处理:

        str.split():切割

        float(str)、int(str):数值转换

      注意:对数据集文件中无关数据的处理(跳行、文件转进制、跳列等过滤)

    2.2 二 训练测试样本

      算法描述:[以鸢尾花分类为例]

        遍历测试样本

          计算测试样本与已标记的样本的欧式距离

        对各欧式距离升序排序

        选择前K项的已样本作为一子集( 即 选择最近的K项邻居作为参照标准)

          遍历统计,已标记子集的花朵种类何种花朵数目种类最多

        设置当前测试样本的预测花朵种类为该种

        结束。

      注释:花的种类分别为:Iris-setosa、Iris-versicolor、Iris-virginica;共计3种。

    2.3 三 计算预测准确率

      rate = Count(测试验证集中,已标记值 == 预测值 的样本) / 测试验证集总数

    2.4 四 模型检验(未做)

  三 编程实现

    (见第三部分示范代码)

  四 总结模型[K-NN]

    针对本问题

      0 样本数据集的样本顺序排列,选拔初始的参照样本空间时,需要先将数据集乱序排序,再做选拔;否则,分类准确率往往趋于0

        原因:对未纳入训练样本对应种类的待测样本,几乎无真实参照集合,所以将导致预测结果差得离谱(准确率趋于0)。

    涉及因素

      0 特征向量Features

        影响算法的处理效率:特征向量数越多,计算量越大,处理时间越长。

        影响算法的结果正确性:K值越多,可参照指标越多,结果越趋于正确。

      1 K:K个最近邻居元素的控制

        控制待预测样本的参照边界

        影响算法的结果正确性:

        K=1时,选拔最近的元素的标记值作为预测值

      2 Weight权值:对参照邻居的选拔标准

        标准:欧式距离、切比雪夫距离、马氏距离(这个,目前不清楚)、最近者赋予更大权值(增加其重要性)

        控制参照样本对待测样本的重要性

        有利于选拔最贴近真实预测结果、最符合的样本

      3 已预测并标记的样本是否加入参照样本集,影响后续待测样本预测?

      4 样本数量与种类

        标准:种类全面、数量按比例丰富;在上前提下,样本越多越好

          否则,尤其是种类覆盖不全面时,可能严重影响对偏未标记种类的样本预测效果

        样本种类↑,数量↑,预测准确率↑,预测处理效率↓

    总结性评价

      1 监督学习、分类问题

      2 基于实例数据的非参数学习算法

        Input:已标记数据集中的K个最近的训练样本组成

        Output:判别待测样本之类型

      3 可用于非线性分类

      4 样本种类↑,数量↑,特征向量↑:预测准确率↑,预测处理效率↓

      5 性能与完美的准确性不能绝对两全

        总体处理的复杂度:O(n)

      6 对异常值不敏感

      7 总体来说,准确度高,无人为因素。

      8 K值大小对结果的准确性要视具体情况而定,人为调参优化

      9 样本数量与种类:

        标准:种类全面、数量按比例丰富;在上前提下,样本越多越好

        否则,尤其是种类覆盖不全面时,可能严重影响对偏未标记种类的样本预测效果

      10   已预测的样本是否加入参照样本空间,将影响后续待测样本对预测结果起多大作用是一个可考虑的问题

      11 其他:

        需要提前知道样本空间之所有种类

        预测样本时,计算量大,[不利于实时预测],偏胖服务器模式

      12 模型常见实践:

        手写数字识别系统

        鸢尾花分类

        爱情片与动作片分类

        约会网站匹配

        对新贷款用户的还款情况预测

        ========================

        文本分类

三 编程实现(For Python)

  工程文件分为三部分:

    __init__.py【main()启动函数、核心算法】

    Iris.py【设计数据结构(类)、模块(职责分离)】

    file_handle.py【数据提取、文件处理】

    由于前面第二部分已经详细叙述,且代码中注释已经十分详细,便不在对代码进行解释,阅读注释便容易懂。

    __init__.py

import random;
import math;
import Iris; # 自定义
import file_handle; # 自定义

#if __name__ == ‘__main__‘: #__name__ == ‘__main__‘是Python的main函数入口
def main(print_test=False,print_samples=False):
    follows = []; # 样本集空间(前sampleAmount项)+测试集空间(后 sampleAll-sampleAmount项)
    data = "";    # 样本数据(前sampleAmount项)+测试集空间(后 sampleAll-sampleAmount项)
    sampleAll = 150;
    sampleAmount = 100; # 标记样本集数目(剩余的便作为测试集)
    k = 5;
    test_print = print_test; 

    ########## 一 读取数据集,装载样本集
    ##### 1.1 加载数据集数据
    data = file_handle.read("./dataset/data.txt",1,‘r‘);#1:忽略第一行
    # print(data);
    list = data.split(‘\n‘);
    i = 0;
    for line in list: # 如:line = "5.1,3.5,1.4,0.2,Iris-setosa"
        item = line.split(‘,‘);# 如:item = [5.1,3.5,1.4,0.2,Iris-setosa]
        label_species = item.pop();#移除最后一项:标记种类
        #print("[test] item:", item,"\tlabel_species:", label_species); # test
        follows.append(Iris.Iris(item,label_species));
        #print("[ ",i," ] ",follows[i].toString());
        i += 1;
        pass;
    random.shuffle(follows); # 【千万注意!!!】由于原数据集是有序的,如果不做乱序处理,预测结果会及其不理想(准确率,趋近于0),当然,这也是这一模型的缺陷之一
    ##### 1.2 选择前100项 作为已标记样本集
    #i = 0;
    #for i in range(sampleAmount):
    #    follows[i].setPredictSpecies(follows[i].label_species);
    #    pass;

    ########## 二 训练测试样本
    ##### 2.1 对101 - 150 项的测试集进行训练/预测
    ## 算法描述:
    ##     遍历测试样本
    ##        计算测试样本与已标记的样本的欧式距离
    ##     对各欧式距离升序排序
    ##     选择前K项的已样本作为一子集( 即 选择最近的K项邻居作为参照标准)
    ##        遍历统计,已标记子集的花朵种类何种花朵数目种类最多
    ##        设置当前测试样本的预测花朵种类为该种
    ##     结束。
    ## 注释:花的种类分别为:Iris-setosa、Iris-versicolor、Iris-virginica;共计3种。
    offset = 0; # 测试空间偏移量:目的是为了将通过偏移量,增大原已标记样本空间的样本数量 即 使已预测的测试样本加入参照样本空间。
    for x in range(sampleAmount,sampleAll):# x:测试样本下标
        weights = [];# 对各欧式距离(权值)的升序排序列表
        for y in range(0,sampleAmount+offset):
            result = (math.sqrt( +                                math.pow(follows[y].features[0] - follows[x].features[0],2) +                                math.pow(follows[y].features[1] - follows[x].features[1],2) +                                math.pow(follows[y].features[2] - follows[x].features[2],2) +                                math.pow(follows[y].features[3] - follows[x].features[3],2)), y);# 存储x,方便排序后定位花朵
            #print("[test] weights[x]:", result);
            weights.append(result);
            pass;
        weights.sort(key = lambda item:item[0]); # 以各元组内第一首项[欧氏距离]为键,默认升序排序
        if test_print:
            for m in range(len(weights)): # 输出预测权重
                print("[test] weights[",m,"]:",weights[m],"\tweights[",m,"][1] > ",weights[m][1],":",follows[weights[m][1]].toString());
        kinds_count = {"Iris-setosa":0,"Iris-versicolor":0,"Iris-virginica":0}; # 对已标记样本空间中各种花的数目统计作初始化
        for z in range(0,k): # 选择前K项的已样本作为一子集( 即 选择最近的K项邻居作为参照标准)
            if test_print:
                print("[test] 排名前",z+1,"项 follows[",z,"]:",follows[weights[z][1]].toString());
            label_species = follows[weights[z][1]].label_species;
            if(label_species == ‘Iris-setosa‘):
                kinds_count["Iris-setosa"] += 1;
            elif label_species == ‘Iris-versicolor‘:
                kinds_count["Iris-versicolor"] += 1;
            elif label_species == ‘Iris-virginica‘:
                kinds_count[‘Iris-virginica‘] += 1;
            else:
                print("[ERROR:Unknown Species] follows[",weight[z][1],"]:",follows[weight[z][1]]);
            pass;
        result =  max(kinds_count.items(), key = lambda item:item[1]); # 取统计花类数字典中最大值对应的序列
        follows[x].predict_species = result[0]; # 标记预测种类
        if test_print:
            print("[test] 预测结果",result, " [follows[",x,"].predict_species]:", follows[x].predict_species); # test
        offset += 1;
        #for test in range(len(weights)): # 测试-输出距离权值结果
        #    print("[",test,"] weights:",weights[test][0],"\t",follows[weights[test][1]].toString());
        #    pass;
        pass;

    ########## 三 计算预测准确率
    rate = 0.0;
    i = 0;
    for i in range(sampleAmount,len(follows)):
        if(follows[i].label_species == follows[i].predict_species):
            rate += 1;
        else:
            print("[预测错误样本] follow[",i,"]:",follows[i].toString());
        pass;
    pass;
    rate = rate / (sampleAll - sampleAmount);
    print("预测准确率:",rate);

    if print_samples:
        for i in range(0,len(follows)):
            print(follows[i].toString());
            pass;
    pass;

main(False,True);

    Iris.py

‘Iris module [class] ‘

__author__ = ‘Johnny Zen‘

class Iris:
    """
    Iris花(类)

    [Demo]
    iris = Iris([5.1,3.5,1.4,0.2],"Iris-setosa");
    print(iris.toString());
    iris.setPredictSpecies(‘Iris-setosa‘);
    print(iris.toString());
    print(iris.label_species);
    =======================
    [features][5.1, 3.5, 1.4, 0.2]    [label-species]Iris-setosa    [predict-species]None
    [features][5.1, 3.5, 1.4, 0.2]    [label-species]Iris-setosa    [predict-species]Iris-setosa
    Iris-setosa
    """
    features = [];
    label_species = None; # 标记种类
    predict_species = None; # 预测种类
    def __init__(self,features,label_species=None):
        if type(features).__name__ == ‘list‘:
            self.features = features;
        else:
            self.features = list(features); # 此list方法对list对象执行将产生错误
            pass;
        for x in range(len(self.features)): # 列表内元素字符串转实数
            self.features[x] = float(self.features[x]);
        self.label_species = label_species;
        pass;
    def setPredictSpecies(self,predict_species=None):#设置预测种类
        self.predict_species = predict_species;
        pass;
    def toString(self):#与一般函数定义不同,类方法必须包含参数 self[第一个参数]
        return "[features]" + str(self.features) + "\t[label]" + str(self.label_species + "\t[predict]" + str(self.predict_species));
        pass;
    pass;

    file_handle.py

"file_handle module [function]:read(filepath,ignore=0,mode=‘r‘)"

def read(filepath,ignore=0,mode=‘r‘):
    try:
        file = open(filepath,mode);
        ## file_content = file.read();
        file_content = ‘‘;
        i = 0;
        for i in range(0,ignore):
            file.readline();
            ##print(i);
            ##print(file.readline());
        for line in file.readlines():
            file_content += line;
    finally:
        if file:
            file.close();
        #print(file_content);
        return file_content;
    pass;

四 参考文献

  [1] K-NN和K-Means算法:https://wenku.baidu.com/view/9544b6ea5a8102d276a22ffe.html

原文地址:https://www.cnblogs.com/johnnyzen/p/9625535.html

时间: 2024-11-04 07:32:24

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