《毕设题目》,老师给拟的,表示我自己看了题目都不知道我到底要干啥。。。
大概是说,利用学校的曙光集群里的MPI并行环境解决一个生物计算。什么生物计算?是对高维小样本数据进行聚类分析(大量的患有某种疾病的患者的DNA数据),分析得出病人的生存时间与哪个或那一组基因的关联最大。
导师提供资料: 该生物计算的理论算法的论文(据说算法可靠),
集群使用手册
登陆集群账号
目前所了解: 集群提供环境:多节点并行运行,各种编译器,支持MPI,数学库,三个生物计算的软件
算法所使用的思想和计算流程。。
没了。
下一步目标: 确定以下= =
1,程序:语言(能够使用MPI的C语言),算法(学姐的毕业设计),数据结构
2,工具:在集群上到底怎么运行(是使用某个生物软件还是直接提交程序),
如何提交程序(pbs学习,若使用生物软件,生物软件提供什么样的功能,如何使用。)
3,能否在实验计算机本地创建实验环境。
怎么办::::::好好看看论文,弄清楚程序需要解决的功能有哪些,确定能否使用集群提供的生物计算软件解决
了解集群利的三种生物软件各都能够提供哪些功能。
----------20170323
时间: 2024-10-10 00:32:02