我的本科毕设

《毕设题目》,老师给拟的,表示我自己看了题目都不知道我到底要干啥。。。

大概是说,利用学校的曙光集群里的MPI并行环境解决一个生物计算。什么生物计算?是对高维小样本数据进行聚类分析(大量的患有某种疾病的患者的DNA数据),分析得出病人的生存时间与哪个或那一组基因的关联最大。

导师提供资料:  该生物计算的理论算法的论文(据说算法可靠),

         集群使用手册

         登陆集群账号

目前所了解:   集群提供环境:多节点并行运行,各种编译器,支持MPI,数学库,三个生物计算的软件

         算法所使用的思想和计算流程。。

         没了。

下一步目标:   确定以下= =  

          1,程序:语言(能够使用MPI的C语言),算法(学姐的毕业设计),数据结构
          2,工具:在集群上到底怎么运行(是使用某个生物软件还是直接提交程序),

           如何提交程序(pbs学习,若使用生物软件,生物软件提供什么样的功能,如何使用。)
          3,能否在实验计算机本地创建实验环境。

怎么办::::::好好看看论文,弄清楚程序需要解决的功能有哪些,确定能否使用集群提供的生物计算软件解决

         了解集群利的三种生物软件各都能够提供哪些功能。

----------20170323

时间: 2024-10-10 00:32:02

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