plink 使用方法

  全基因组关联分析是利用统计方法研究与性状相关联的基因。常用的软件有plink,tassel,falmm等,

其中尽管R语言中提供了几种常见的文件格式,个人感觉plink文件格式已经成为了广泛使用的基本格式。下面

是我在学习期间的plink学习总结,请笑纳:

  其样本数据和代码详见https://github.com/xuezoushi/Studynote/basic plink method:

时间: 2024-10-12 15:31:44

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haploview出现"invalid affected status"的解决方法

haploview弹出这种错误是因为haploview的缺失值默认为0,而plink文件的缺失值一般用"-9"表示,当ped文件的缺失值为"-9"时,haploview不认得该字符,就弹出错误提示.解决方法为用0替代"-9". 在linux界面中,用vim命令编辑ped文件后,输入以下字符 :1,$s/-9/0/g "1"表示从该文件的第一行至最后一行,"/-9/0/"表示将该文件的"-9&quo

一种远程修改sqlite数据库的方法

一.实际需求 工业设备DA660是专门用来实现工业上可编程设备之间交换信息的交换机.现在要使得DA660采集下行设备的实时数据,然后传送到上位机显示.上位机还可以远程修改DA660的数据库配置. 二.数据库设计 我在DA660中设计了sqlite3数据库,名为da660.db,里面存放很多表,其中有一张表示baseinfo,其结构定义如下: 通道号是从0到15之间的正整数,从机地址是从0到256之间的正整数,设备类型定义为0到5之间的正整数,设备类型可从{"xz2000", "

使用ssh正向连接、反向连接、做socks代理的方法

ssh -L 219.143.16.157:58080:172.21.163.32:8080 用户名@localhost -p 10142 在 219.143.16.157机器执行   将ssh隧道打通 将172.21.163.32:8080 映射到本机58080上 1.用ssh做正向连接 啥叫正向连接?就是client连上server,然后把server能访问的机器地址和端口(当然也包括server自己)镜像到client的端口上. 命令: ssh -L [客户端IP或省略]:[客户端端口]:

putty的下载安装和基本使用方法教程

PuTTY是一款开源(Open Source Software)的连接软件,主要由Simon Tatham维护,使用MIT许可证授权.包含的组件有:PuTTY, PuTTYgen,PSFTP, PuTTYtel, Plink, PSCP, Pageant,默认登录协议是SSH,默认的端口为22.Putty是用来远程连接服务器的,支持SSH.Telnet.Serial等协议的连接.其中最常用的是SSH.用它来远程管理Linux十分好用,其主要优点如下: ◆ 完全免费; ◆ 在Windows 9x/

plink和pscp命令使用(登录linux并执行命令/linux和Windows服务器文件互拷)

1. 使用Putty提供的plink.exe来自动登陆一个机器并执行命令,完成后自己关闭 bat文件内容如下: D:\Download\Software\Putty-0.60\plink.exe -pw jointforce2004 [email protected]192.168.0.1 "/root/testconn.sh; getkey" 这个命令就是登陆到192.168.0.1上,执行命令:/root/testconn.sh; getkey ,然后自动退出. linux下get

Unity 崩溃问题解决方法——之一

友情提示:工作随记,不喜勿喷 注意:文艺青年可以略过,暴力青年欢迎采纳 Library文件夹 Unity每次编译都会生成这个东西,不用担心丢失的问题.所以,干掉他! 选中 + Delete   或者  选中 + Shift  + Delete 网上看了很多方法,就觉得这个简单,粗暴,是我喜欢的类型. 优点:上面说了 缺点:如果工程过大,重新编译时间会比较长.(但是对于查Log日志来说,相对快点)

Java TM 已被阻止,因为它已过时需要更新的解决方法

公司的堡垒机需要通过浏览器登陆,且该堡垒机的网站需要Java的支持,最近通过浏览器登陆之后总是提示"java TM 已被阻止,因为它已过时需要更新的解决方法"导致登陆之后不能操作, 但是操作系统中确实已经安装了比较新的JDK,安装的JDK版本是jdk-7u67-windows-i586,因为太烦人,所以决定搞清楚报错的原因,一劳永逸,彻底解决这个问题 准备工作:安装JDK,安装版本jdk-7u67-windows-i586.exe,因为机器的Eclipse还依赖64位的JDK,所以另安

win7 64位系统 PB连接oracle数据库出现“oracle library oci.dll could not be loaded”问题的解决方法

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C#与数据库访问技术总结(八)之ExecuteNonQuery方法

ExecuteNonQuery方法 ExecuteNonQuery方法主要用来更新数据. 通常使用它来执行Update.Insert和Delete语句. 该方法返回值意义如下: 对于Update.Insert和Delete语句,返回值为该命令所影响的行数. 对于所有其他类型的语句,返回值为-1. Command对象通过ExecuteNonQuery方法更新数据库的过程非常简单,需要进行的步骤如下: (1)创建数据库连接. (2)创建Command对象,并指定一个SQL Insert.Update