基因 GO

利用DAVID简单的进行GO富集度分析(这里只做简单的分析,即看基因是否存在在GO的三个过程里面)

比如我们有一组要分析的基因:TRPV6    CXADR    PROM1    GRAMD2    SOX10    GPRIN2    VANGL2    GRHL1    BCL11A    MROH8(这里用的是关于人的基因名)

首先打开DAVID网页,选择Functional Annotation:

在左边的框里面按提示输入,步骤1,输入你的ID号,这里可以是基因ID,也可以是基因名,或者是其它的,但是如果你是基因名,则在步骤2选择GENE SYMBOL

选好后,点提交:

点击确定,就出现下面:

选择人类的类型(Homo sapiens),点击select Species:

点击右边的Gene_Ontology,在GO的三大类中,可以看出在BP中,我们提交的10个基因中有7个在BP中对应有GO Term项。同理还有CC,MF的也可以看出。

本人还在学习当中,如有不对请指出。

时间: 2024-10-30 16:56:55

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