Mapreduce为了确保每个reducer的输入都按键排序。系统执行排序的过程-----将map的输出作为输入传给reducer 称为shuffle。学习shuffle是如何工作的有助于我们理解mapreduce工作机制。shuffle属于hadoop不断被优化和改进的代码库的一部分。从许多方面看，shuffle是mapreduce的“心脏”，是奇迹出现的地方。
下面这张图介绍了mapreduce里shuffle的工作原理：
从图可以看出shuffle发生在map端和reduce端之间，将map端的输出与reduce端的输入对应。
map 端
map函数开始产生输出时，并不是简单地将它输出到磁盘。这个过程更复杂，利用缓冲的方式写到内存，并出于效率的考虑进行预排序。shuffle原理图就看出来。
每个map任务都有一个环形内存缓冲区，用于存储任务的输出。默认情况是100MB，可以通过io.sort.mb属性调整。一旦缓冲内容达到阀值（io.sort.spill.percent,默认0.80，或者80%），一个后台线程开始把内容写到磁盘中。在写磁盘过程中，map输出继续被写到缓冲区，但如果在此期间缓冲区被填满，map会阻塞直到写磁盘过程完成。在写磁盘之前，线程首先根据数据最终要传送到reducer把数据划分成相应的分区，在每个分区中，后台线程按键进行内排序，如果有一个combiner，它会在排序后的输出上运行。
reducer通过HTTP方式得到输出文件的分区。用于文件分区的工作线程的数量由任务的tracker.http.threads属性控制，此设置针对每个tasktracker，而不是针对每个map任务槽。默认值是40，在运行大型作业的大型集群上，此值可以根据需要调整。
reducer端
map端输出文件位于运行map任务的tasktracker的本地磁盘，现在，tasktracker需要为分区文件运行reduce任务。更进一步，reduce任务需要集群上若干个map任务完成，reduce任务就开始复制其输出。这就是reduce任务的复制阶段。reduce任务有少量复制线程，所以能并行取得map输出。默认值是5个线程，可以通过设置mapred.reduce.parallel.copies属性改变。
在这个过程中我们由于要提到一个问题，reducer如何知道要从那个tasktracker取得map输出呢？
map任务成功完成之后，它们通知其父tasktracker状态已更新，然后tasktracker通知jobtracker。这些通知都是通过心跳机制传输的。因此，对于指定作业，jobtracker知道map输出和tasktracker之间的映射关系。reduce中的一个线程定期询问jobtracker以便获得map输出的位置，直到它获得所有输出位置。
由于reducer可能失败，因此tasktracker并没有在第一个reducer检索到map输出时就立即从磁盘上删除它们。相反，tasktracker会等待，直到jobtracker告知它可以删除map输出，这是作业完成后执行的。
如果map输出相当小，则会被复制到reduce tasktracker的内存（缓冲区大小由mapred.job.shuffle.input.buffer.percent属性控制），否则，map输出被复制到磁盘。一旦内存缓冲区达到阀值大小（由mapred.job.shuffle.merge.percent决定）或达到map输出阀值(mapred.inmem.merge.threshold控制)，则合并后溢出写到磁盘中。
随着磁盘上副本的增多，后台线程会将它们合并为更大的、排好序的文件。这会为后面的合并节省一些时间。注意，为了合并，压缩的map输出都必须在内存中被解压缩。
复制完所有map输出被复制期间，reduce任务进入排序阶段(sort phase 更恰当的说法是合并阶段，因为排序是在map端进行的)，这个阶段将合并map输出，维持其顺序排序。这是循环进行的。比如，如果有50个map输出，而合并因子是10 (10默认值设置，由io.sort.factor属性设置，与map的合并类似)，合并将进行5趟。每趟将10个文件合并成一个文件，因此最后有5个中间文件。
在最后阶段，即reduce阶段，直接把数据输入reduce函数，从而省略了一次磁盘往返行程，并没有将5个文件合并成一个已排序的文件作为最后一趟。最后的合并既可来自内存和磁盘片段。
在reduce阶段，对已排序输出中的每个键都要调用reduce函数。此阶段的输出直接写到输出文件系统中。