算法的思想是初始选取M个种子点,将周围点的特征和种子点特征进行距离的测定,距离最小的点和该种子点归为一类。则可以分为M个类别,计算这些类别特征的质心作为新的种子点,再次分类,如此迭代n次后的结果便是聚类分割的结果。
K-means也是聚类算法中最简单的一种了,但是里面包含的思想却是不一般。最早我使用并实现这个算法是在学习韩爷爷那本数据挖掘的书中,那本书比较注重应用。看了Andrew Ng的这个讲义后才有些明白K-means后面包含的EM思想。
聚类属于无监督学习,以往的回归、朴素贝叶斯、SVM等都是有类别标签y的,也就是说样例中已经给出了样例的分类。而聚类的样本中却没有给定y,只有特征x,比如假设宇宙中的星星可以表示成三维空间中的点集。聚类的目的是找到每个样本x潜在的类别y,并将同类别y的样本x放在一起。比如上面的星星,聚类后结果是一个个星团,星团里面的点相互距离比较近,星团间的星星距离就比较远了。
在聚类问题中,给我们的训练样本是,每个,没有了y。
K-means算法是将样本聚类成k个簇(cluster),具体算法描述如下:
1、 随机选取k个聚类质心点(cluster centroids)为。 2、 重复下面过程直到收敛 { 对于每一个样例i,计算其应该属于的类 对于每一个类j,重新计算该类的质心 } |
K是我们事先给定的聚类数,代表样例i与k个类中距离最近的那个类,的值是1到k中的一个。质心代表我们对属于同一个类的样本中心点的猜测,拿星团模型来解释就是要将所有的星星聚成k个星团,首先随机选取k个宇宙中的点(或者k个星星)作为k个星团的质心,然后第一步对于每一个星星计算其到k个质心中每一个的距离,然后选取距离最近的那个星团作为,这样经过第一步每一个星星都有了所属的星团;第二步对于每一个星团,重新计算它的质心(对里面所有的星星坐标求平均)。重复迭代第一步和第二步直到质心不变或者变化很小。
下图展示了对n个样本点进行K-means聚类的效果,这里k取2。
K-means面对的第一个问题是如何保证收敛,前面的算法中强调结束条件就是收敛,可以证明的是K-means完全可以保证收敛性。下面我们定性的描述一下收敛性,我们定义畸变函数(distortion function)如下:
J函数表示每个样本点到其质心的距离平方和。K-means是要将J调整到最小。假设当前J没有达到最小值,那么首先可以固定每个类的质心,调整每个样例的所属的类别来让J函数减少,同样,固定,调整每个类的质心也可以使J减小。这两个过程就是内循环中使J单调递减的过程。当J递减到最小时,和c也同时收敛。(在理论上,可以有多组不同的和c值能够使得J取得最小值,但这种现象实际上很少见)。
由于畸变函数J是非凸函数,意味着我们不能保证取得的最小值是全局最小值,也就是说k-means对质心初始位置的选取比较感冒,但一般情况下k-means达到的局部最优已经满足需求。但如果你怕陷入局部最优,那么可以选取不同的初始值跑多遍k-means,然后取其中最小的J对应的和c输出。
下面累述一下K-means与EM的关系,首先回到初始问题,我们目的是将样本分成k个类,其实说白了就是求每个样例x的隐含类别y,然后利用隐含类别将x归类。由于我们事先不知道类别y,那么我们首先可以对每个样例假定一个y吧,但是怎么知道假定的对不对呢?怎么评价假定的好不好呢?我们使用样本的极大似然估计来度量,这里是就是x和y的联合分布P(x,y)了。如果找到的y能够使P(x,y)最大,那么我们找到的y就是样例x的最佳类别了,x顺手就聚类了。但是我们第一次指定的y不一定会让P(x,y)最大,而且P(x,y)还依赖于其他未知参数,当然在给定y的情况下,我们可以调整其他参数让P(x,y)最大。但是调整完参数后,我们发现有更好的y可以指定,那么我们重新指定y,然后再计算P(x,y)最大时的参数,反复迭代直至没有更好的y可以指定。
这个过程有几个难点,第一怎么假定y?是每个样例硬指派一个y还是不同的y有不同的概率,概率如何度量。第二如何估计P(x,y),P(x,y)还可能依赖很多其他参数,如何调整里面的参数让P(x,y)最大。这些问题在以后的篇章里回答。
这里只是指出EM的思想,E步就是估计隐含类别y的期望值,M步调整其他参数使得在给定类别y的情况下,极大似然估计P(x,y)能够达到极大值。然后在其他参数确定的情况下,重新估计y,周而复始,直至收敛。
上面的阐述有点费解,对应于K-means来说就是我们一开始不知道每个样例对应隐含变量也就是最佳类别。最开始可以随便指定一个给它,然后为了让P(x,y)最大(这里是要让J最小),我们求出在给定c情况下,J最小时的(前面提到的其他未知参数),然而此时发现,可以有更好的(质心与样例距离最小的类别)指定给样例,那么得到重新调整,上述过程就开始重复了,直到没有更好的指定。这样从K-means里我们可以看出它其实就是EM的体现,E步是确定隐含类别变量,M步更新其他参数来使J最小化。这里的隐含类别变量指定方法比较特殊,属于硬指定,从k个类别中硬选出一个给样例,而不是对每个类别赋予不同的概率。总体思想还是一个迭代优化过程,有目标函数,也有参数变量,只是多了个隐含变量,确定其他参数估计隐含变量,再确定隐含变量估计其他参数,直至目标函数最优。
#include "opencv/cxcore.h"
#include "opencv/highgui.h"
#include<opencv2\opencv.hpp>
#include <iostream>
using namespace std;
//Set element in Matrix
void SetMatElem(CvMat *mat, int row, int col, int channel, int val)
{
((float*)(mat->data.ptr+mat->step*row))[col*mat->step+channel]= val;
}
class Color
{
int num;
public:
int b, g, r;
Color(){ b= 0; g= 0; r=0;num=0;}
Color(int x, int y, int z) { b=x; g= y; r =z; num=0;}
void Add( int x, int y, int z)//Calcuate average color
{
b=( b*num+x)/(num+1);
g=( g*num+y)/(num+1);
r= (r*num+z)/(num+1);
++num;
cout << num<<endl;
}
};
int main( int argc, char** argv )
{
IplImage *src,*dst;
int cluster_num;
//Load image
if (argc==2){
src= cvLoadImage(argv[1]);
}
else{
src= cvLoadImage("nature4.jpg");
}
if( src == 0) { cout<<"Cannot open the file!"; return(1000);}
//Read input, get the number of clusters
cout<<"Please input cluster number:";
cin>>cluster_num;
Color *color_tab= new Color[cluster_num]();
CvMat *sample = cvCreateMat(src->height*src->width, 1, CV_32FC(5));
CvMat *cluster = cvCreateMat(src->height*src->width, 1, CV_32SC1);
//Initalize Matrix for 5-D vector to store each pixel info.in image
for( int i=0; i<src->height ;i++){ //row
for( int j=0; j<src->width; j++){
//col
long int index= i*src->width+j;
SetMatElem(sample,index,0,0,i);
SetMatElem(sample,index,0,1,j);
SetMatElem(sample,index,0,2,CV_IMAGE_ELEM(src,uchar,i,j*3));
SetMatElem(sample,index,0,3,CV_IMAGE_ELEM(src,uchar,i,j*3+1));
SetMatElem(sample,index,0,4,CV_IMAGE_ELEM(src,uchar,i,j*3+2));
}
}
//Do KMeans to Matrix sample, and store result in Matrix cluster
cvKMeans2(sample, cluster_num, cluster,
cvTermCriteria( CV_TERMCRIT_EPS+CV_TERMCRIT_ITER, 10, 10 ));
dst = cvCreateImage(cvGetSize(src),8,3);
cvZero(dst);
//Visit each pixel in original image, calculate average color in each clusters
//and store result in Table color_tab
for(int i=0; i<dst->height; i++){
for( int j=0; j<dst->width; j++){
long int index= i* dst->width+j;
int cluster_idx= cluster->data.i[index];
int x= CV_IMAGE_ELEM(src,uchar, i, j*3);
int y= CV_IMAGE_ELEM(src,uchar, i, j*3+1);
int z= CV_IMAGE_ELEM(src,uchar, i, j*3+2);
color_tab[cluster_idx].Add(x,y,z);
}
}
//Assign average color in cluster to destination image
for(int i=0; i<dst->height; i++){
for( int j=0; j<dst->width; j++){
long int index= i* dst->width+j;
int cluster_idx= cluster->data.i[index];
CV_IMAGE_ELEM(dst,uchar, i, j*3) = color_tab[cluster_idx].b;
CV_IMAGE_ELEM(dst,uchar, i, j*3+1) = color_tab[cluster_idx].g;
CV_IMAGE_ELEM(dst,uchar, i, j*3+2) = color_tab[cluster_idx].r;
}
}
//Show image
cvNamedWindow("K-means Segmentation Result");
cvShowImage("K-means Segmentation Result", dst);
cv::Mat dst1(dst->width,dst->height,CV_8UC1);
for (int i = 0; i<dst->height; i++){
for (int j = 0; j<dst->width; j++){
long int index = i* dst->width + j;
int cluster_idx = cluster->data.i[index];
dst1.at<uchar>(i, j) = cluster_idx*50;
}
}
cv::imshow("dst1", dst1);
cvWaitKey(-1);
cvReleaseMat(&sample);
cvReleaseMat(&cluster);
cvReleaseImage(&src);
cvReleaseImage(&dst);
}