RDD:基于内存的集群计算容错抽象

本文转载:http://shiyanjun.cn/archives/744.html

摘要

本文提出了分布式内存抽象的概念——弹性分布式数据集(RDD,Resilient Distributed Datasets),它具备像MapReduce等数据流模型的容错特性,并且允许开发人员在大型集群上执行基于内存的计算。现有的数据流系统对两种应用的处理并不高效:一是迭代式算法,这在图应用和机器学习领域很常见;二是交互式数据挖掘工具。这两种情况下,将数据保存在内存中能够极大地提高性能。为了有效地实现容错,RDD提供了一种高度受限的共享内存,即RDD是只读的,并且只能通过其他RDD上的批量操作来创建。尽管如此,RDD仍然足以表示很多类型的计算,包括MapReduce和专用的迭代编程模型(如Pregel)等。我们实现的RDD在迭代计算方面比Hadoop快20多倍,同时还可以在5-7秒内交互式地查询1TB数据集。

1.引言

无论是工业界还是学术界,都已经广泛使用高级集群编程模型来处理日益增长的数据,如MapReduce和Dryad。这些系统将分布式编程简化为自动提供位置感知性调度、容错以及负载均衡,使得大量用户能够在商用集群上分析超大数据集。

大多数现有的集群计算系统都是基于非循环的数据流模型。从稳定的物理存储(如分布式文件系统)中加载记录,记录被传入由一组确定性操作构成的DAG,然后写回稳定存储。DAG数据流图能够在运行时自动实现任务调度和故障恢复。

尽管非循环数据流是一种很强大的抽象方法,但仍然有些应用无法使用这种方式描述。我们就是针对这些不太适合非循环模型的应用,它们的特点是在多个并行操作之间重用工作数据集。这类应用包括:(1)机器学习和图应用中常用的迭代算法(每一步对数据执行相似的函数);(2)交互式数据挖掘工具(用户反复查询一个数据子集)。基于数据流的框架并不明确支持工作集,所以需要将数据输出到磁盘,然后在每次查询时重新加载,这带来较大的开销。

我们提出了一种分布式的内存抽象,称为弹性分布式数据集(RDD,Resilient Distributed Datasets)。它支持基于工作集的应用,同时具有数据流模型的特点:自动容错、位置感知调度和可伸缩性。RDD允许用户在执行多个查询时显式地将工作集缓存在内存中,后续的查询能够重用工作集,这极大地提升了查询速度。

RDD提供了一种高度受限的共享内存模型,即RDD是只读的记录分区的集合,只能通过在其他RDD执行确定的转换操作(如map、join和group by)而创建,然而这些限制使得实现容错的开销很低。与分布式共享内存系统需要付出高昂代价的检查点和回滚机制不同,RDD通过Lineage来重建丢失的分区:一个RDD中包含了如何从其他RDD衍生所必需的相关信息,从而不需要检查点操作就可以重构丢失的数据分区。尽管RDD不是一个通用的共享内存抽象,但却具备了良好的描述能力、可伸缩性和可靠性,但却能够广泛适用于数据并行类应用。

第一个指出非循环数据流存在不足的并非是我们,例如,Google的Pregel[21],是一种专门用于迭代式图算法的编程模型;Twister[13]和HaLoop[8],是两种典型的迭代式MapReduce模型。但是,对于一些特定类型的应用,这些系统提供了一个受限的通信模型。相比之下,RDD则为基于工作集的应用提供了更为通用的抽象,用户可以对中间结果进行显式的命名和物化,控制其分区,还能执行用户选择的特定操作(而不是在运行时去循环执行一系列MapReduce步骤)。RDD可以用来描述Pregel、迭代式MapReduce,以及这两种模型无法描述的其他应用,如交互式数据挖掘工具(用户将数据集装入内存,然后执行ad-hoc查询)。

Spark是我们实现的RDD系统,在我们内部能够被用于开发多种并行应用。Spark采用Scala语言[5]实现,提供类似于DryadLINQ的集成语言编程接口[34],使用户可以非常容易地编写并行任务。此外,随着Scala新版本解释器的完善,Spark还能够用于交互式查询大数据集。我们相信Spark会是第一个能够使用有效、通用编程语言,并在集群上对大数据集进行交互式分析的系统。

我们通过微基准和用户应用程序来评估RDD。实验表明,在处理迭代式应用上Spark比Hadoop快高达20多倍,计算数据分析类报表的性能提高了40多倍,同时能够在5-7秒的延时内交互式扫描1TB数据集。此外,我们还在Spark之上实现了Pregel和HaLoop编程模型(包括其位置优化策略),以库的形式实现(分别使用了100和200行Scala代码)。最后,利用RDD内在的确定性特性,我们还创建了一种Spark调试工具rddbg,允许用户在任务期间利用Lineage重建RDD,然后像传统调试器那样重新执行任务。

本文首先在第2部分介绍了RDD的概念,然后第3部分描述Spark API,第4部分解释如何使用RDD表示几种并行应用(包括Pregel和HaLoop),第5部分讨论Spark中RDD的表示方法以及任务调度器,第6部分描述具体实现和rddbg,第7部分对RDD进行评估,第8部分给出了相关研究工作,最后第9部分总结。

2.弹性分布式数据集(RDD)

本部分描述RDD和编程模型。首先讨论设计目标(2.1),然后定义RDD(2.2),讨论Spark的编程模型(2.3),并给出一个示例(2.4),最后对比RDD与分布式共享内存(2.5)。

2.1 目标和概述

我们的目标是为基于工作集的应用(即多个并行操作重用中间结果的这类应用)提供抽象,同时保持MapReduce及其相关模型的优势特性:即自动容错、位置感知性调度和可伸缩性。RDD比数据流模型更易于编程,同时基于工作集的计算也具有良好的描述能力。

在这些特性中,最难实现的是容错性。一般来说,分布式数据集的容错性有两种方式:即数据检查点和记录数据的更新。我们面向的是大规模数据分析,数据检查点操作成本很高:需要通过数据中心的网络连接在机器之间复制庞大的数据集,而网络带宽往往比内存带宽低得多,同时还需要消耗更多的存储资源(在内存中复制数据可以减少需要缓存的数据量,而存储到磁盘则会拖慢应用程序)。所以,我们选择记录更新的方式。但是,如果更新太多,那么记录更新成本也不低。因此,RDD只支持粗粒度转换,即在大量记录上执行的单个操作。将创建RDD的一系列转换记录下来(即Lineage),以便恢复丢失的分区。

虽然只支持粗粒度转换限制了编程模型,但我们发现RDD仍然可以很好地适用于很多应用,特别是支持数据并行的批量分析应用,包括数据挖掘、机器学习、图算法等,因为这些程序通常都会在很多记录上执行相同的操作。RDD不太适合那些异步更新共享状态的应用,例如并行web爬行器。因此,我们的目标是为大多数分析型应用提供有效的编程模型,而其他类型的应用交给专门的系统。

2.2 RDD抽象

RDD是只读的、分区记录的集合。RDD只能基于在稳定物理存储中的数据集和其他已有的RDD上执行确定性操作来创建。这些确定性操作称之为转换,如map、filter、groupBy、join。

RDD不需要物化。RDD含有如何从其他RDD衍生(即计算)出本RDD的相关信息(即Lineage),据此可以从物理存储的数据计算出相应的RDD分区。

2.3 编程模型

在Spark中,RDD被表示为对象,通过这些对象上的方法(或函数)调用转换。

定义RDD之后,程序员就可以在动作中使用RDD了。动作是向应用程序返回值,或向存储系统导出数据的那些操作,例如,count(返回RDD中的元素个数),collect(返回元素本身),save(将RDD输出到存储系统)。在Spark中,只有在动作第一次使用RDD时,才会计算RDD(即延迟计算)。这样在构建RDD的时候,运行时通过管道的方式传输多个转换。

程序员还可以从两个方面控制RDD,即缓存和分区。用户可以请求将RDD缓存,这样运行时将已经计算好的RDD分区存储起来,以加速后期的重用。缓存的RDD一般存储在内存中,但如果内存不够,可以写到磁盘上。

另一方面,RDD还允许用户根据关键字(key)指定分区顺序,这是一个可选的功能。目前支持哈希分区和范围分区。例如,应用程序请求将两个RDD按照同样的哈希分区方式进行分区(将同一机器上具有相同关键字的记录放在一个分区),以加速它们之间的join操作。在Pregel和HaLoop中,多次迭代之间采用一致性的分区置换策略进行优化,我们同样也允许用户指定这种优化。

2.4 示例:控制台日志挖掘

本部分我们通过一个具体示例来阐述RDD。假定有一个大型网站出错,操作员想要检查Hadoop文件系统(HDFS)中的日志文件(TB级大小)来找出原因。通过使用Spark,操作员只需将日志中的错误信息装载到一组节点的内存中,然后执行交互式查询。首先,需要在Spark解释器中输入如下Scala命令:

lines = spark.textFile("hdfs://...")
errors = lines.filter(_.startsWith("ERROR"))
errors.cache()

第1行从HDFS文件定义了一个RDD(即一个文本行集合),第2行获得一个过滤后的RDD,第3行请求将errors缓存起来。注意在Scala语法中filter的参数是一个闭包。

这时集群还没有开始执行任何任务。但是,用户已经可以在这个RDD上执行对应的动作,例如统计错误消息的数目:errors.count()

用户还可以在RDD上执行更多的转换操作,并使用转换结果,如:

// Count errors mentioning MySQL:
errors.filter(_.contains("MySQL")).count()
// Return the time fields of errors mentioning HDFS as an array (assuming time is field
// number 3 in a tab-separated format):
errors.filter(_.contains("HDFS")).map(_.split(‘\t‘)(3)).collect()

使用errors的第一个action运行以后,Spark会把errors的分区缓存在内存中,极大地加快了后续计算速度。注意,最初的RDD lines不会被缓存。因为错误信息可能只占原数据集的很小一部分(小到足以放入内存)。
最后,为了说明模型的容错性,图1给出了第3个查询的Lineage图。在lines RDD上执行filter操作,得到errors,然后再filter、map后得到新的RDD,在这个RDD上执行collect操作。Spark调度器以流水线的方式执行后两个转换,向拥有errors分区缓存的节点发送一组任务。此外,如果某个errors分区丢失,Spark只在相应的lines分区上执行filter操作来重建该errors分区。

时间: 2024-11-08 14:39:41

RDD:基于内存的集群计算容错抽象的相关文章

网格计算, 云计算, 集群计算, 分布式计算, 超级计算

网格计算, 云计算, 集群计算, 分布式计算, 超级计算 整体来说都有将任务分割.运算.组合,只是协同和处理的重点不同: 超级计算强调的是高并行计算能力,应用设备多是超级计算机如天河一号,是infiniband的高并行处理架构,实现总线级协同,一般采用计算能力更强的GPU而非CPU:集群计算和分布式计算是相对于设备部署结构来说,这种计算相对超算来说,对于计算的并行处理及响应要求较低,需要实现的是网络环境下的协同,实现的效果受网络环境影响.网格计算是集群计算和分布式计算与超级计算中间的产物,是在原

Windows Server 2016基于工作组的集群

Windows Server 2016基于工作组的集群 Part1: 资源分配 成员1 Server01 192.168.10.10 Windows Server 2016 Datacenter SQL Server 2016 Enterprise With SP1 成员2 Server02 192.168.10.11 Windows Server 2016 Datacenter SQL Server 2016 Enterprise With SP1 成员3 Server03 192.168.1

一种改进的red5集群方案的应用、基于Red5服务器集群负载均衡调度算法研究

转自: 一种改进的red5集群方案的应用: http://wenku.baidu.com/link?url=jYQ1wNwHVBqJ-5XCYq0PRligp6Y5q6BYXyISUsF56My8DP8dc9CZ4pZvpPz1abxJn8fojMrL0IyfmMHStpvkotqC1RWlRMGnzVL1X4IPOa_ 基于Red5服务器集群负载均衡调度算法研究 http://www.doc88.com/p-0456863461331.html

Spark Streaming性能优化系列-如何获得和持续使用足够的集群计算资源?

一:数据峰值的巨大影响 1. 数据确实不稳定,例如晚上的时候访问流量特别大 2. 在处理的时候例如GC的时候耽误时间会产生delay延迟 二:Backpressure:数据的反压机制 基本思想:根据上一次计算的Job的一些信息评估来决定下一个Job数据接收的速度. 如何限制Spark接收数据的速度? Spark Streaming在接收数据的时候必须把当前的数据接收完毕才能接收下一条数据. 源码解析 RateController: 1. RateController是监听器,继承自Streami

基于已有集群动态发现方式部署 Etcd 集群

etcd提供了多种部署集群的方式,在「通过静态发现方式部署etcd集群」 一文中我们介绍了如何通过静态发现方式部署集群. 不过很多时候,你只知道你要搭建一个多大(包含多少节点)的集群,但是并不能事先知道这几个节点的ip,从而无法使用--initial-cluster参数. 这个时候,你就需要使用discovery的方式来搭建etcd集群.discovery方式有两种:etcd discovery和DNS discovery. 这里我们先介绍下etcd discovery方式.这种启动方式依赖另外

基于mysql数据库集群的360度水平切割

1.why sharding? 我们都知道,信息行业发展日益迅速,积累下来的数据信息越来越多,互联网公司门要维护的数据日益庞大.设想一下,假如腾讯公司只用一个数据库的一张表格来存储所有qq注册用户的登录相关信息,毫不夸张的说,那好比就是一场灾难,腾讯少说都有好几个亿的用户,所有的信息都存储在一个数据库的一张表中,那么我们的sleect语句那得多么的消耗硬件资源,用户体验度那是相当的差的,基本上不能去运行了,那谁还去用qq,那怎么办呢,数据分割这时候就派上用场了,它根据数据的特性,将一张表单上的内

Spark调研笔记第7篇 - 应用实战: 如何利用Spark集群计算物品相似度

本文是Spark调研笔记的最后一篇,以代码实例说明如何借助Spark平台高效地实现推荐系统CF算法中的物品相似度计算. 在推荐系统中,最经典的推荐算法无疑是协同过滤(Collaborative Filtering, CF),而item-cf又是CF算法中一个实现简单且效果不错的算法. 在item-cf算法中,最关键的步骤是计算物品之间的相似度.本文以代码实例来说明如何利用Spark平台快速计算物品间的余弦相似度. Cosine Similarity是相似度的一种常用度量,根据<推荐系统实践>一

Master-Worker集群计算demo

Task为要执行的任务实体类: package com.viewhigh.mdop.bi.test; /** * Created by zzq on 2017/5/11. */ public class Task { private int id; private String name; public int getId() { return id; } public void setId(int id) { this.id = id; } public String getName() {

工作笔记之基于Hadoop2.6集群的MapReduce

由wordcount执行一步一步记录mapreduce的开发过程 1.执行wordcount 2.最简单的mapreduce 3.自定义