samtools merge error

trunk merge branch的时候报错 xxx must be ancestrally related to xxx,这个报错的意思是两者不关联,所以需要去建立关联. [回顾背景] 代码初始是先建立了branch,然后从branch copy to trunk.这个先后顺序有问题.应该是先建立trunk,再打branch,branch修改之后,再合并到trunk [具体解决] 因为目前branch的代码是最新的,那么,目标是让trunk成为最新代码,然后再关联起来. 1.先删除现有tru

1. 2.

$ git rm --cached iLedger.xcodeproj/project.xcworkspace/xcuserdata/Alex.xcuserdatad/UserInterfaceState.xcuserstate $ git commit -m "Removed the stupid strange file that shouldn't be tracked"

samtools的说明文档:http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtml samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集.包含有许多命令.以下是常用命令的介绍 1. view view命令的主要功能是:将sam文件转换成bam文件:然后对bam文件进行各种操作,比如数据的排序(不属于本命令的功能)和提取(这些操作 是对bam文件进行的,因而当输入为sam文件的时候,不能进行该操作):最后将排序或提取得到的数据输出为bam或sam(默认的

转自:http://www.cnblogs.com/emanlee/p/4316581.html samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集.包含有许多命令.以下是常用命令的介绍 1. view view命令的主要功能是:将sam文件转换成bam文件:然后对bam文件进行各种操作,比如数据的排序(不属于本命令的功能)和提取(这些操作 是对bam文件进行的,因而当输入为sam文件的时候,不能进行该操作):最后将排序或提取得到的数据输出为bam或sam(默认的)格式. bam文件优点

samtools: Utilities for the SAM format 下面介绍一下samtools 常用的功能: 1,对fasta文件建立index samtools faidx ref.fasta 2, 将sam文件转化为bam文件 samtools view -bS in.sam > in.bam 3, 查看bam文件的head信息 samtools view -H in.bam 4, 将bam文件进行sort samtools sort aln.bam anl.sorted   #

当用samtools把sam转化成bam时出错,出现以下提示,主要是因为sam文件由maf-convert转化而来,maf-convert只能处理两条序列的比对文件.因此如若想得到多条序列的bam文件,只能两两比对文件转化成bam文件,再用samtools merge 对多个bam文件进行合并.

官方文档 合并多个清单文件 Merge multiple manifest files APK 文件只能包含一个 AndroidManifest.xml 文件,但 Android Studio 项目 may contain several provided by the main source set, build variants, and imported libraries.因此,在构建应用时,Gradle 构建会 merges all manifest files into a sing

零.前言 "不懂就问",但是这里的"问"是指问百度和谷歌,实在不懂再问人! 上谷歌教程,参考文章:谷歌浏览器插件与电脑软件推荐 (1)生信论坛推荐 生信技能树(生信菜鸟团),有很多优秀的帖子,以及对应的微信公众号,其它生信微信公众号优秀的文章它会转载,所以关注这个够了,历史消息值得翻阅一遍: PLoB:https://www.plob.org/ Biostars,国外生信论坛 (2)文本文件浏览软件 nodepad++.sublime text.破解版的UE 一.l