1、参考文档：
spark-1.3.0：http://spark.apache.org/docs/1.3.0/running-on-yarn.html
spark-1.6.0：http://spark.apache.org/docs/1.6.0/running-on-yarn.html
备注：从spark-1.6.0开始，spark on yarn命令有略微改变，具体参考官方文档，这里以spark 1.3.0集群为主。
2、前期准备
编译spark，参看文档：http://www.cnblogs.com/wcwen1990/p/7688027.html
spark安装部署（包括local模式和standalone模式）：http://www.cnblogs.com/wcwen1990/p/6889521.html
3、spark on yarn配置：
1）启动hadoop集群：
sbin/hadoop-daemon.sh start namenode
sbin/hadoop-daemon.sh start datanode
sbin/yarn-daemon.sh start resourcemanager
sbin/yarn-daemon.sh start nodemanager
sbin/mr-jobhistory-daemon.sh start historyserver
2）启动spark历史日志服务：
sbin/start-history-server.sh
3）查看进程信息：
$ jps
3182 DataNode
3734 JobHistoryServer
3949 Jps
3555 NodeManager
3295 ResourceManager
3857 HistoryServer
3094 NameNode
4、spark-submit方式提交应用到yarn（提交可以以client模式和cluster模式进行应用提交）：
1）spark-1.3.0：
$ ./bin/spark-submit --class path.to.your.Class --master yarn-cluster [options] <app jar> [app options]
For example:
$ ./bin/spark-submit --class org.apache.spark.examples.SparkPi \
--master yarn-cluster \
--num-executors 3 \
--driver-memory 4g \
--executor-memory 2g \
--executor-cores 1 \
--queue thequeue \
lib/spark-examples*.jar \
10
2）spark-1.6.0：
$ ./bin/spark-submit --class path.to.your.Class --master yarn --deploy-mode cluster [options] <app jar> [app options]
For example:
$ ./bin/spark-submit --class org.apache.spark.examples.SparkPi \
--master yarn \
--deploy-mode cluster \
--driver-memory 4g \
--executor-memory 2g \
--executor-cores 1 \
--queue thequeue \
lib/spark-examples*.jar \
10
5、spark-shell方式运行在yarn上(spark-shell只能通过client模式运行)：
1）spark-1.3.0：
$ ./bin/spark-shell --master yarn-client
2）spark-1.6.0：
$ ./bin/spark-shell --master yarn --deploy-mode client
6、测试，这里以spark-1.3.0为例：
$ ./bin/spark-shell --master yarn-client
spark on yarn模式下运行wordcount程序：
scala> sc.textFile("/user/hadoop/mapreduce/wordcount/input/wc.input").flatMap(_.split(" ")).map((_,1)).reduceByKey(_ + _).map(x => (x._2,x._1)).sortByKey(false).map(x => (x._2,x._1)).collect
... ...
res0: Array[(String, Int)] = Array((scala,1), (hive,1), (oozie,1), (mapreduce,1), (zookeeper,1), (hue,1), (yarn,1), (sqoop,1), (kafka,1), (spark,1), (hadoop,1), (flume,1), (hdfs,1), (storm,1), (hbase,1))
scala> sc.stop
以上程序运行过程可以通过web ui查看详情，具体地址有以下几个：
spark应用监控：http://chavin.king:4040
历史日志服务：http://chavin.king:18080