当用samtools把sam转化成bam时出错,出现以下提示,主要是因为sam文件由maf-convert转化而来,maf-convert只能处理两条序列的比对文件。因此如若想得到多条序列的bam文件,只能两两比对文件转化成bam文件,再用samtools merge 对多个bam文件进行合并。
时间: 2024-10-22 16:46:03
当用samtools把sam转化成bam时出错,出现以下提示,主要是因为sam文件由maf-convert转化而来,maf-convert只能处理两条序列的比对文件。因此如若想得到多条序列的bam文件,只能两两比对文件转化成bam文件,再用samtools merge 对多个bam文件进行合并。