Python之SparCC模块安装

<Inferring Correlation Networks from Genomic Survey Data>是篇讲从基因组数据得到基因间相关性的文章.该方法主要思想是逐步消除主基因的影响.地址:http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pcbi.1002687.

文章最后给出了一个python模块,地址https://bitbucket.org/yonatanf/sparcc .

wget https://bitbucket.org/yonatanf/sparcc/get/9a1142c179f7.zip -nc -O ~/download/yonatanf-sparcc-9a1142c179f7.zip
unzip ~/download/yonatanf-sparcc-9a1142c179f7.zip -d /opt
时间： 2024-10-17 00:11:36

Python之SparCC模块安装的相关文章

python中的模块安装

python中的模块研究: 需要用import导入的模块都是用python实现的. 内建的部分是用c.c++实现的. pypi:第三方的python包. 在windows上安装python: 1.安装python到C:\PythonXX,添加系统环境变量path:C:\PythonXX. 安装pypi库的方法三种方法: 1．在pypi上下载安装包离线安装 cd  $package-dir python   setup.py  install 在windos的cmd上也可以这样安装. 3．用eas

yum安装memcache,mongo扩展以及python的mysql模块安装

//启动memcached/usr/local/memcached/bin/memcached -d -c 10240 -m 1024 -p 11211 -u root/usr/local/memcached/bin/memcached -d -c 10240 -m 1024 -p 11212 -u root 1.安装mongodb mongodb安装在/usr/local/mongod 目录下mkdir /usr/local/mongod/data //存放数据, touch /usr/loc

Python的MySQLdb模块安装

在配置Django时,选择的是mysql数据库,要安装MySQLdb模块,不过安装过程中,遇到了很多errors,记录一下. 系统:ubuntu 11.10 mysql:直接apt-get安装的,version:5.1.62 到官方下载MySQL for Python 然后解压,打开README: 里面有安装过程: $ tar xfz MySQL-python-1.2.1.tar.gz $ cd MySQL-python-1.2.1 $ # edit site.cfg if necessary

python之twisted模块安装

Twisted是一个事件驱动的网络框架. 最近开始学习了解Twisted,首先肯定要安装twisted模块. 但是在cmd下执行:pip install twisted 出现了下面的问题:"error:Microsoft Visual C++ 10.0 is required (Unable to find vcvarsall.bat) 我电脑是pyhton3.4环境(python2.7也有),没有装VC++ 10.0,所以根据error提示,我得去装个VC++ 10.0?? 但是我并不想~,于

python的自动化模块安装

以前所用的操作系统是centos,如今用的操作系统是debian,所以开始适应,转变. debian安装之后发现默认没有安装ssh,所以先安装ssh服务并启动 apt-get install ssh /etc/init.d/ssh start 接下来安装pexpect,paramiko模块. 若要安装上面的模块,先安装setuptools模块. 安装setuptools模块 wget  tar xf  setuptools-3.3.tar.gz cd setuptools-3.3 python 

python之第三方模块安装

1. 直接打开cmd窗口运行 pip install xxx   #可联网情况下使用,联网下载    xxx表示要安装的模块名称 pip问题及解决方法:1. 配置环境变量,将如下两个路径都加到系统path中.这里装的是集成环境,单个python的时候,也需要将python的安装目录和安装目录下面的scripts目录加入环境变量.       C:\ProgramData\Anaconda3       C:\ProgramData\Anaconda3\Scripts2.Unknow or uns

python的PIL模块安装

一.Centos安装PIL #尤其重要,否则会报错 yum install python-devel yum install libjpeg libjpeg-devel zlib zlib-devel freetype freetype-devel lcms lcms-devel yum install python-imaging #这个地址较快,如果哪天访问不了了,换官方的 wget http://effbot.org/downloads/Imaging-1.1.7.tar.gz tar x

python的MYSQLdb模块在linux环境下的安装

开始学习python数据库编程后,在了解了基本概念,打算上手试验一下时,卡在了MYSQLdb包的安装上,折腾了半天才解决.记录一下我在linux中安装此包遇到的问题.系统是ubuntn15.04. 1.下载 第一个问题是pycharm软件的模块安装功能Project Interpreter无法自动下载安装MYSQLdb包,显示 Error occurred when installling package 那没办法了,只好手动下载了.MYSQLdb包linux系统的下载的地址是 http://s

Mac OS X 下安装python的MySQLdb模块

参考资料: mac os x下python安装MySQLdb模块   http://www.codeif.com/post/1073/ MAC OSX使用Python安装模块有关问题  http://www.myexception.cn/operating-system/1616547.html 在Mac OS X 中安装好了MySQL和Django,在Django中访问MySQL数据库时,提示“ImportError: No module named MySQLdb”,是由于没有安装Pytho