MappedByteBuffer的实际开发遇到的问题

今天在做一个文件上传的时候遇到读取文件使用到了MappedByteBuffer这个类，网上看了一大推资料说这个类在处理读取文件时比较好，尤其是大型文件，

代码如下：messagedigest = MessageDigest.getInstance("MD5");
            
            in = new FileInputStream(file);
            ch = in.getChannel();
            MappedByteBuffer byteBuffer = ch.map(FileChannel.MapMode.READ_ONLY, 0,
                    file.length());
            messagedigest.update(byteBuffer);
            md5 = bufferToHex(messagedigest.digest()).toUpperCase();
            byteBuffer.clear();

最后调用时删除原来的的文件时，总是删不掉，后来进行物理删除发现该文件时被程序占用，最后一步步排除发现是MappedByteBuffer这个类在捣鬼，发现网上有说有两种解决方法，比较用的是显示调用System.gc()方法，但如果有框架如果禁用这种调用垃圾回收器的话，就有问题了，，

网上发现有两片文章说的好 http://www.cnblogs.com/ironPhoenix/p/4204472.html   http://www.cnblogs.com/huxi2b/p/6637425.html

　不过自己最后通过实现byteBuffer.flip()方法后，可以解决以上两篇文章说到的弊端，可以删除原文件了。

　　不知道是自己侥幸还是什么情况，希望大神能帮忙分析下原因，让小弟更明白，主要对计算机的线程和进程原理你是很理解。