Lammps安装1

 lamps非并行安装：

1  下载并解压

进入lammps主页（http://lammps.sandia.gov/）下载最新版本：

打开download页面：http://lammps.sandia.gov/download.html，在“LAMMPS molecular dynamics package” 中点击：

 LAMMPS --- Stable version (10 Aug 2015) - Recent C++ version source tarball, GPL license, ~87 Mb. Includes all bug fixes and new features described on this page, up to the date of the most recent stable release.

假设源码包 lammps-stable.gz放在/mnt目录下，用如下命令解压：

gunzip lammps-stable.tar.gz

tar xvf lammps-stable.tar

或直接 tar -zxvf lammps-stable.tar.gz

2 安装并使用

mv lammps-5Dec10 lmpan  (重命名为lmpan)

新版的安装非常简单，只需要键入 make serial 就可以了。

生成 lmp_serial 之后，就可以将其cp到 intel/bin 里面，因为bin这个路径已经在 .bashr 环境下已经有了明确的路径了。

计算的时候，先体会里面自带的 example

cd /lmpan/example/shear

lmp<in.shear  即开始计算

附录

新版的Makefile.serial如下：

# serial = g++ compiler, no MPI
SHELL = /bin/sh
# ---------------------------------------------------------------------
# compiler/linker settings
# specify flags and libraries needed for your compiler
CC =        g++
CCFLAGS =    -g -O3
SHFLAGS =    -fPIC
DEPFLAGS =    -M

LINK =        g++
LINKFLAGS =    -g -O
LIB =
SIZE =        size

ARCHIVE =    ar
ARFLAGS =    -rc
SHLIBFLAGS =    -shared

旧板需要修改makefile.serial。

cd lmpan/src/STUBS
make clean
make

cd /lmpan/src/MAKE
vi Makefile.serial 后出现：

# g++ = RedHat Linux box, g++4, gfortran, no MPI,no FFT
SHELL = /bin/sh
# ---------------------------------------------------------------------
# compiler/linker settings
# specify flags and libraries needed for your compiler
CC =        g++4   将 g++4 改为 g++
CCFLAGS =    -g -O
DEPFLAGS =    -M
LINK =       g++4   将g++4 改为 g++
LINKFLAGS =  -g -O
LIB =
ARCHIVE =    ar
ARFLAGS =    -rc
SIZE =      size

然后存档并退出：cd /lmpan/src

make clean-all

make serial

之后linux开始编译，最后会在/lmpan/src下生成lmp_serial的可执行文件。