基因组注释之基因功能注释

1、下载所需的数据库及软件

nr数据库已经有了，这里不做介绍

2、pfam数据库

wget ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/current_release/Pfam-A.hmm.gzwget ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/current_release/Pfam-A.hmm.dat.gzwget ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/current_release/active_site.dat.gz

原文地址：https://www.cnblogs.com/djx571/p/12324605.html

时间： 2024-10-03 15:48:08

基因组注释之基因功能注释的相关文章

基因组序列注释（基因结构预测）

基因组组装完后需要对基因组序列进行注释.注释前首先得构建基因模型,有三种策略: 从头注释(de novo prediction):通过已有的概率模型来预测基因结构,在预测剪切位点和UTR区准确性较低同源预测(homology-based prediction):有一些基因蛋白在相近物种间的保守型高,所以可以使用已有的高质量近缘物种注释信息通过序列联配的方式确定外显子边界和剪切位点基于转录组预测(transcriptome-based prediction):通过物种的RNA-seq数据辅助注

GO 功能注释

文章转载于 Original 2017-06-12 liuhui 生信百科相似的基因在不同物种中,其功能往往保守的.显然,需要一个统一的术语用于描述这些跨物种的同源基因及其基因产物的功能,否则,不同的实验室对相同的基因的功能的描述不同,将极大限制学术的交流.而 Gene Ontology (GO) 项目正是为了能够使对各种数据库中基因获基因产物功能描述相一致的努力结果. 所谓的 GO,是生物学功能注释的一个标准词汇表术语(GO term),将基因的功能分为三部分: 基因执行的分子功能(Mole

将c语言注释转换成c++注释

可以分为7种情况 1.一般情况 /* int i = 0; */ 2.换行问题 /* int i = 0; */ int j = 0; 3.匹配问题 /int i = 0;/*xxxxx/ 4.多行注释问题 /* int i=0; int j = 0; int k = 0; */int k = 0; 5.连续注释问题 //// 6.连续的**/问题 /*/ 7.C++注释问题 // /xxxxxxxxxxxx/ 转换之后结果 1.一般情况 // int i = 0; 2.换行问题 // int

MySQL追加注释或者大量修改注释

MySQL追加注释或者大量修改注释 2016-01-25 20:28:05 分类: MySQL MySQL 5.6.14 之前一个项目比较仓促,开发给的建表语句没有注释.现在要补全注释信息.但是MySQL后期追加注释比较麻烦需要使用modify语法. 只要不小心写错一点,就可能导致表结构的变更,而不是注释的变更. 实验表如下: create table t( c1 int primary key auto_increment, c2 char(20) not null default 'c2'

Linux配置文件注释注意：行首注释，不要行中注释

正确注释: # 注释语句错误注释:这种注释可能导致文件读取异常或报错有效语句 # 注释语句 # 注释语句

HTML  注释、CSS/JS //注释和 /...../ 注释

是HTML的注释标签,使用<和>是符合HTML标签语法规则的. /* */(注释代码块).//(注释单行)是CSS和JS的注释标签. 两种注释有各自的使用环境,并且不能相互替代. 举例如下: 1. 2.//注释内容 (在css或javascript中插入单行注释) 3./*注释内容*/ (在css或javascript中插入多行注释) 一,HTML  注释标签所有浏览器都支持注释标签. 注释标签用

Java基础入门 - 三种注释及文档注释详解

类似C/C++,Java也支持单行和多行注释注释中的字符在编译时会被忽略注释通常为类.变量和方法的主要描述单行注释 // 注释内容多行注释 /* 注释内容 */ /* * 注释内容 */ 文档注释 /** * 注释内容 */ 文档注释可使用javadoc工具来生成信息,并输出到HTML文件中,方便记录程序信息文档注释中可包含一个或多个@标签,每个@标签都在新的一行开始多个相同的标签应一个接一个的放在一起组成一组实例:SquareNum.java import java.io.*;

Python def longestPalindrome(self, s: str) -> str: 函数功能注释 annotations

https://www.cnblogs.com/hongten/p/hongten_python_function_annotation.html def f(ham: 42, eggs: int = 'spam') -> "Nothing to see here": print("Annotations:", f.__annotations__) print("Arguments:", ham, eggs) #def关键字定义了函数f,在

MyEclipse自动生成注释，编辑默认注释模板

自动生成方法注释: 写完方法后,在该方法上方输入/**后,按下回车键,会自动生成该方法注释. /** * * @param uid * @return */ public Map<String, String> getSysUserId(String uid) { } 编辑默认注释模板: 1.类注释:Window -> Preferences -> Java -> Code Style -> Code Templates -> Code