soapdenovo

SOAPdenovo-63mer_v2.0 all -s TongJiN2.config -p 25 -K 63 -d 1 -R -F -o Lily_2 1>ass.log 2>ass.err

-s config file

-o prefix of output file name

-K kmer size

-p number of cpu to use

-d no larger than this value will be deleted

-R resolve repeats by reads

-F fill gaps in scaffold

时间： 2024-12-29 01:33:33

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