文献名:Development of a High Coverage Pseudotargeted Lipidomics Method Based on Ultra-High Performance Liquid Chromatography−Mass Spectrometry(基于超高效液相色谱-质谱法的高覆盖拟靶向脂质组学方法的开发)
期刊名:Analytical Chemistry
发表时间:(2018年5月)
IF:6.38
单位:
- 中国科学院大连化学物理研究所
- 中国科学院大学
生物材料:细胞,血浆,鼠肝
技术:拟靶向代谢组学
一、 概述:(用精炼的语言描述文章的整体思路及结果)
本研究开发了一种脂质分析的新方法,该方法可以避免非靶向和靶向脂质组学的缺点,结合两者的优点,并用建立好拟靶向脂质组学的方法分析了30例糖尿病病人和30例正常对照组血浆脂质组的差异,发现了163个差异表达的脂质。
二、 研究背景:(简要介绍研究进展动态、研究目的和意义)
脂质组学是一种功能强大的分析工具,可以分析复杂生物样本中内源性和外源性脂质的变化。根据脂质的头基以及酰基链之间的连接方式,可以将脂质进行分类;脂质的酰基链的长度不同(碳原子数不同),不饱和程度和支链不同等等特点,使得用单一脂质组学的方法不可能完全表征整个脂质组。
研究脂质组学的方法主要是LC-MS,并且可以分为非靶向脂质组学和靶向脂质组学两种策略;非靶向脂质组学可以检测所有的脂质,但是由于在数据采集过程中每个峰采集的点不够,所以该方法的线性和重复性会受到影响;并且非靶向脂质组学后续的数据分析非常复杂;靶向脂质组学检测的脂质比较有限,但是检测的灵敏度高,线性和重复性比较好,且不需要复杂的峰提取过程;本研究结合非靶向和靶向脂质组学的优势,开发出一种高覆盖的拟靶向脂质组学的方法。
三、实验设计:
该研究首先用UHPLC-HRMS非靶向脂质组学基于全扫描和数据依赖的方法检测了细胞,血浆,鼠肝的脂质,从而得到尽可能多的脂质;其次,这些脂质根据其保留时间、一级和碎片离子的质荷比进行分类;没有碎片离子的脂类和有碎片离子的脂质进行精确质量数和保留时间进行比较并且参考LipidMaps数据库;没有检测到但是理论上存在的脂质根据其检测到的脂质的酰基链碳键数和双键数和保留时间的关系进行预测;最后,这些脂质的离子对(基于非靶得到的一级质量数和碎片离子的质量数)用MRM的方法进行监测。
最后,用建立好的方法用于糖尿病病人血浆脂质组的分析。
四、研究成果:(重点图表展示)
1、总共建立了3377个脂质的离子对(正离子模式下2846个,负离子模式下531个)的数据库,包含19类脂质下分类大约7000个脂质分子。
2、糖尿病病人和健康组的混合血浆脂质总共有823个脂质被检测到,进而进一步用于分析糖尿病病人和对照组差异表达的脂质;脂质被检测到的标准是:脂质离子对在2/3的样品中都被检测到,且其保留时间的偏差的绝对值小于0.5min。
3、和健康对照组的比较,在糖尿病病人的血浆中总共有163个差异表达的脂质,这些结果表明该方法可以有效的鉴别和糖尿病相关的差异表达的脂质。
五、文章亮点(结论讨论):
本研究开发了用于脂质组学研究的一个新的方法。
阅读人:赵倩倩
原文地址:https://www.cnblogs.com/ilifeiscience/p/12015716.html