一般分析任务运行内存大小

1　　QC：逐条过滤，内存不大，如果是压缩文件取决于缓冲大小，一般设置1G；

2　　SOAPAligner：比对需要读入reference，取决于reference大小，比较大的如人类hg19和细菌，设置15G左右；

3　　SOAP denovo：组装软件，取决于数据量，大约设置为数据量的10倍，一般高通量数据一个sample以4G算的话，设置40G等；

4　　velvet：组装软件，比SOAP denovo耗内存要多一些，在SOAP基础上按需增加，一般比Soapdenovo多设置50%；

5　　预测，MetaGeneMark：内存消耗很小，1-2G足够；

时间： 2024-08-26 20:00:36

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