Matlab && C-Mex Round 1

  前言:本篇文章主要通过一个简单的例子程序对C-Mex进行一个初步的说明。前期的环境搭建(包括安装Matlab和gcc编译器)就不在这里赘述了。

  首先,为什么要使用C-Mex?说开了,就是程序的效率问题。最近,我在做一个并行化的项目,原来的程序是用Matlab编写的,运行时间为6个小时以上,在我改成Matlab和C(或C++)混编之后,运行时间缩减到2分钟不到。天!180多倍的加速比,不敢想象!当然,并不是每一个程序改成C之后都能得到这么大的提速,关键还要看程序本身的计算量和访存的频繁程度。

  那么,mex文件是什么呢?Mex文件其实是其他语言与Matlab的接口。通过这个接口,我们可以像使用Matlab函数(即.m文件)一样的方式使用其他语言编写的程序。例如,下面一个最最简单的矩阵加法的例子。

matlab主函数(main.m):

1 %编译c文件
2 mex addVector.cpp;
3
4 %初始化参数
5 A = [1 2 3; 4 5 6];
6 B = [7 8 9; 2 3 4];
7
8 %调用mex文件
9 C = addVector(A,B);

  该Matlab程序非常简单,首先编译文件addVector.cpp,然后声明连个变量A和B。最后将A和B作为函数addVector的参数,调用函数并返回结果保存为C。这里,你可能会注意到addVector.cpp是c++文件,其实并没有什么区别,编译器会自动帮你识别区分c和c++程序。不过,要是你有强迫症的话,也可以写成.c文件,前提是你的文件里面没有诸如类和对象这些C语言没有的东西(C这个单身狗怎么可能有对象呢,哈哈哈......)。

  咦,那使用语句“mex addVector.cpp”来编译我们的C文件,编译后的文件是怎样的呢?来来来,请看下面:

  

  你看看那蓝色的家伙“addVector.mexw64"就是我们使用mex命令编译后的可执行文件了。在使用的时候,我们只需要喊一下她的名字”addVector“,然后把参数传进去,她就会老老实实的听你话啦!嘿嘿嘿,是不是很美妙呢!那么,后缀名"mexw64"又是什么东西,这个嘛!其实后缀名“mexw64”中的“mex”是告诉大家这个文件是mex文件啦!然后,“w64”是说这个文件只能在64位的windows系统下使用啦!没有什么的呐。

  我说她会老老实实听话,难道你信了啊?当然,我没有骗你,但是你肯定要先对她好才行呀。那么,怎么对她好呢?接下来,我来给大家介绍咋们的正主“addVector.cpp"。咋们轻解罗衫,细细品尝。请细看:

 1 #include "mex.h"
 2 #include <stdio.h>
 3
 4 //nlhs为输出参数个数,nrhs为输入参数个数
 5 //plhs为输出参数指针,prhs为输入参数指针
 6 void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, mxArray *prhs[])
 7 {
 8     //获取输入数据
 9     int i=0;
10     double* inputMatric_A   = (double*)mxGetData(prhs[i++]);//matlab传过来的参数默认为double类型
11     double* inputMatric_B   = (double*)mxGetData(prhs[i++]);
12
13     //获得第一个参数的行数和列数
14     int numRowsA = (int)mxGetM(prhs[0]);
15     int numColsA = (int)mxGetN(prhs[0]);
16     printf("numRowsA = %d\n",numRowsA);
17     printf("numColsA = %d\n",numColsA);
18
19     //生成输出输出
20     plhs[0] = mxCreateDoubleMatrix(numRowsA,numColsA,mxREAL);   //三个参数分别为行数,列数和数据类型,mxREAL为实数
21     double* outputMatric_C = (double*)mxGetData(plhs[0]);    //创建指针指向输出数据
22
23     //计算并将结果放入输出数据区
24     int dataSize = numRowsA * numColsA; //矩阵A元素总个数
25     for(i=0; i<dataSize; i++)
26     {
27         outputMatric_C[i] = inputMatric_A[i] + inputMatric_B[i];
28     }
29 }

  嘻嘻!代码有点长,整整29行呀!先看一下头文件吧,计算最前面#include那两行啦!”#include “mex.h"呢,是把那些你要用到的函数的函数声明先包含进来,你看看下面调用的那些函数,所有你没看到过的就是啦!”include <stdio.h>"只是C的io流头文件而已呐,没有什么的,不要告诉我你不会C,瞬移回去学完再来。

  前方高能,请看第6行代码,没错,就是那个函数“void mexFunction( int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, mxArray *prhs[])"。你问我这是什么鬼?我TM哪知道了。我只知道它是她的心脏,必须存在。你写C程序不是还要一个main函数作为入口吗?那你写mex程序也要一个入口呀,这个入口就是”mexFunction“啦!入口,入口,懂不!我知道你懂,嘿嘿嘿!咦,那这个函数怎么有那么多个参数呀!我记得main函数只有两个参数呀,叫什么”argc“和”argv的“。小傻瓜,人家是C-Mex啦,跟C哪能一样呀,虽然我们都没有对象。既然你想知道,那我就跟你讲清楚咯。看到没,四个参数:”nlhs“,”plhs“,”nrhs“,”prhs“。哇塞,长得好像!n开头的是参数个数,”nlhs“和”nrhs“分别是输出参数个数和输入参数个数,像我们上面的例子就是nlhs=1,nrhs=3啦。p开头的呢就是指向输入数据的指针啦,”plhs“和”prhs“分别是指向输出数据和输入数据的指针。你看看,人家传递的参数是指针,多好,不用把数据再复制一遍。Matlab那个家伙声明了两个变量A和B,把他们放到仓库(内存)里了,然后把仓库的位置(内存地址,即指针)告诉我,我(C)要用的时候就可以直接去那里取啦!嘻嘻,我把仓库里的原材料(A和B)拿来做成蛋糕(outputMatric_c),然后放到我的小仓库(plhs[0])里,然后Matlab就可以来拿去吃啦!原汁原味,又不浪费多余的空间。

  在来细细斟酌一下具体的内容。9~11行,我们把参数一个接一个拿出来。记得哦!我们拿到的都是指针哦!Matlab传递的参数一般是double类型的咯,所以你的"inputMatric_A"等都要是double类型的咯。如果你从Matlab传过来的参数是float类型的就改成float类型的咯。

  既然有了输入数据,那么我们还要做一个放小蛋糕的仓库(输出数据)呀!那么,这个仓库(内存)要多大呢?你喜欢咯!14~21行就是在做这件事情咯,我们得到参数prhs[0]的行号和列号就是要用来规定仓库的大小的呐。numRowsA x numColsA,这么大哦!

  虽然我们给输出参数plhs[0]分配了空间,但是我们肯定是不能直接操作这个指针的呀!我们用另一个指针”outputMatric_C”指向这个内存空间,然后把结果保存在"outputMatric_C"就可以啦!毕竟plhs[0]和“outputMatric_C”本质上是一个东西,只是他们类型不一样,一个是mxArray类型的,一个是double类型的。

  突然发现自己废话有点多啊!还是赶紧总结一下吧,别说话,看图:

  

  首先先写C或C++的源文件咯,写完编译一下生成可执行文件咯!搞定之后,就可以在Matlab程序中调用咯,输入参数和输出参数的参数你自己决定咯。

  好咯,这篇文章就写到这里咯!我要去吃饭啦!闪人!!!

  2016-04-24 11:32:02

时间: 2024-11-13 08:20:05

Matlab && C-Mex Round 1的相关文章

Windows 64 + Matlab 64 MEX混合编程初步

说明 Matlab混合编程 下载与安装编译器 Microsoft Windows SDK 71CC TDM-GCCgccg 选择编译器 编写ccpp文件 mexFunction函数介绍 编译多个ccpp文件 ProblemSolution 找不到编译器或SDK Problem Solution 注意 error C2143 syntax error Problem Solution 说明 Matlab版本:Matlab R2014a 64-bit 操作系统版本:Windows 8.1 64-bi

Matlab以MEX方式调用C源代码【转载】

原文地址:http://blog.sina.com.cn/s/blog_468651400100coas.html 如果我有一个用C语言写的函数,实现了一个功能,如一个简单的函数: double add(double x, double y) { return x + y; } 现在我想要在Matlab中使用它,比如输入: >> a = add(1.1, 2.2) 3.3000 要得出以上的结果,那应该怎样做呢? 解决方法之一是要通过使用MEX文件,MEX文件使得调用C函数和调用Matlab的

Matlab与C/C++联合编程之Matlab以MEX方式调用C/C++代码(二)

如果我有一个用C语言写的函数,实现了一个功能,如一个简单的函数: double add(double x, double y) { return x + y; } 现在我想要在Matlab中使用它,比如输入: >> a = add(1.1, 2.2) 3.3000 要得出以上的结果,那应该怎样做呢? 解决方法之一是要通过使用MEX文件,MEX文件使得调用C函数和调用Matlab的内置函数一样方便.MEX文件是由原C代码加上MEX文件专用的接口函数后编译而成的.可以这样理解,MEX文件实现了一种

Matlab与C/C++联合编程之Matlab以MEX方式调用C/C++代码(三)

最近写了个Matlab程序,好慢呐……所以开始学习Matlab与C/C++混合编程.下面写了个测试代码,显示一个Double类型矩阵中的元素. 源代码 #include "mex.h" void displaySubscript( const mxArray *pArray, mwSize index ); // 入口函数void mexFunction( int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[] ) {   

使用matlab进行mex编译时的路径问题mexopts

matlab和vs 进行混合编程时总需要使用matlab编译mexFunction.cpp文件.这些文件免不了使用include下的*.h和lib下的*.lib文件.举例说明,这次我的cpp中用到了opencv/cv.h.在matlab\bin\win64\mexopts文件夹下有一个msvsopts100.bat的批处理文件. 用notepad 将这个文件打开在"include=" 和 "lib=" 后面添加需要使用的路径并加分号";" 设置好

ubuntu系统下cmake 编译matlab中mex文件

cmake 编译工程具有独特的优势,特别对于复杂的工程更是如此.利用matlab直接编译mex文件时,对于文件数据多的工程时,需要列举所有文件,并且要按照依赖关系排序,这些都是直接采用matalb编译mex的缺点. 下面通过一个简单的加法函数例子,说明如何利用cmake编译生成mex文件.如何对系统动态库进行设置,使matlab能够正常调用mex函数. 首先说明如何生成mex文件. 本例首先利用add.h.add.cpp文件编译生成add.so动态文件库,然后利用mian.cpp文件调用add.

matlab采用mex编译多个cpp文件

最近在看matlab code时,由于本人使用的是64系统,而code中的mex文件时在32位系统上编译的,所以需要重新自己编译maxflowmex.cpp,但是直接mex maxflowmex.cpp时,出现以下错误: maxflowmex.obj : error LNK2019: 无法解析的外部符号 "public: __cdecl Graph<float,float,float>::Graph<float,float,float>(int,int,void (__c

Mac Mojave(10.14.1)执行Matlab的mex报错

先装了matlab2018b,发现很频繁的crash,同时考虑到要跑的代码在>=2017a时就计算错误,于是转战matlab2016b matlab2016b安装后,执行mex -setup报错: >> mex -setup find: 37589: No such file or directory find: 37592: No such file or directory find: 37595: No such file or directory 哪位大神知道解决办法麻烦告知下谢

编写 Matlab mexFunction (C mex)

资料一 MATLAB的MEX文件编写和调试 1. MEX的编写格式 写MEX程序其实就是写一个DLL程序,所以你可以使用C,C++,Fortran等多种编程语言来写. 编写MEX程序的编辑器可以使用MATLAB的代码编辑器,也可使用自己的C++编辑器,如VS2008等. 用MATLAB的编辑器的好处是,MEX函数会加粗高亮显示,这给程序编写带来便利,可惜无法动态调试.如用VC即可编译也可调试,比较方便.mex的编译结果实际上就是一个带输出函数mexFunction 的dll文件,所以会用VC编写

Linux Matlab mex gcc 版本

一般MATLAB的mex支持的gcc版本都比最新的gcc要低一些,所以一般要配置一下. 假设当前版本的gcc是4.8,matlab支持4.6,可以使用以下的方式解决(任选一种).(自己装好gcc-4.6) 修改安装目录下的mexopts.sh 使用管理员权限,修改/usr/local/MATLAB/R20**/bin/mexopts.sh,将 CC=gcc 改成 CC=gcc-4.6. 这种修改的效果是全局的,影响所有用户. 修改自己目录下的mexopts.sh 将/usr/local/MATL