首先下载激活工具：激活工具下载
首先：windows下激活，这是最简单的了。
1.首先确保安装了java6和myeclipse9.0，并没有打开MyEclipse9.0。
找到MyEclipse的安装目录（具体根据个人安装情况而定，可以使用搜索），我的电脑上默认是在：C:\Users\Sun\AppData\Local\MyEclipse（注意AppData是隐藏文件）
找到Common\plugins\com.genuitec.eclipse.core_9.0.0.me201103181703.jar，这个文件，使用解压缩软件打开（比如winrar for win, betterzip for mac）
经将com\genuitec\eclipse\core\publicKey.bytes文件替换为激活工具中的同名文件。
2.破解MyEclipse9.0自检查程序文件完整性，若不改，那公钥破解会导致MyEclipse自检查失败，自动退出
用文本编辑器打开MyEclipse9.0\myeclipse.ini文件，在最后添加如下两行并保存：
-Dgenuitec.honorDevMode=true
-Dosgi.dev=true
3.启动MyEclipse9.0，执行myeclipse9_keygen_activator.exe(注册机)，在Subscriptor栏填写你喜欢的英文名称，点击Generate Subscription Code会生成Subscription
Myeclipse中，菜单栏-->MyEclipse-->Subscriber Information，在Subscriber栏输入刚才的英文名，Subscription Code用刚才获取的。
如果你是x86的系统，此时点击Generate Activation Code便会生成Activation Code
如果你是x64的系统，你有两种选择：
1)安装x86的jdk然后执行（可能要添加环境变量），我也是这么做的。
2)与下面linux和mac的获取方法一致
输入Subscription Code之后，点击 Save & Activate Now-->I already have an activation code-->next-->粘贴那一长串的激活码。
如果失败会有一个红色的小叉
如果成功会打一个提示点击"next"。
至此，windows下myeclipse 9.0激活成功！！！
linux与mac激活，大致与win下一致，但是由于不能运行.exe文件，获取Activation Code是一个问题。
关键还是systemid的问题，而myeclipse是可以自己获取到systemid的。
在选择激活方式的时候，不是选择I already have an activation code，而是选Webactivation，
下一步之后如下图所示，复制途中红色部分，那个就是systemid。
如果你仅仅把这个systemid复制到激活工具中去是不行的，激活工具的systemid是通过那个systemidtools.jar文件获取的，这时需要你自己写一个jar文件，把这个systemid传给激活工具，代码特别简单，如下
public class Test｛
public static void main(String[] args){
System.out.println("你的systemid")；
}
｝
这样就好了，打印的部分就是你获取的systemid，把这个类导出jar，命名为systemidtools.jar替换激活文件夹里面的对应文件就好了。在点击获取激活码便可以了。
需要注意的是:我的mac下myeclipse.ini文件在/Applications/MyEclipse/MyEclipse 9.app/Contents/Profile/myeclipse.app/Contents/MacOS文件夹下（我可找了大半天啊）不知道是怎么回事。
附Red Hat Enterprise Linux 与 Mac OS X 10.7 下的激活图