当前常用的电子邮件协议有SMTP、POP3、IMAP4，它们都隶属于TCP/IP协议簇，默认状态下，分别通过TCP端口25、110和143建立连接。下面分别对其进行简单介绍。
1、SMTP协议
SMTP的全称是“Simple Mail Transfer Protocol”，即简单邮件传输协议。它是一组用于从源地址到目的地址传输邮件的规范，通过它来控制邮件的中转方式。SMTP 协议属于TCP/IP协议簇，它帮助每台计算机在发送或中转信件时找到下一个目的地。SMTP 服务器就是遵循SMTP协议的发送邮件服务器。SMTP认证，简单地说就是要求必须在提供了账户名和密码之后才可以登录 SMTP 服务器，这就使得那些垃圾邮件的散播者无可乘之机。增加 SMTP 认证的目的是为了使用户避免受到垃圾邮件的侵扰。SMTP目前已是事实上的E-Mail传输的标准。
2、POP协议
POP邮局协议负责从邮件服务器中检索电子邮件。它要求邮件服务器完成下面几种任务之一：从邮件服务器中检索邮件并从服务器中删除这个邮件；从邮件服务器中检索邮件但不删除它；不检索邮件，只是询问是否有新邮件到达。POP协议支持多用户互联网邮件扩展，后者允许用户在电子邮件上附带二进制文件，如文字处理文件和电子表格文件等，实际上这样就可以传输任何格式的文件了，包括图片和声音文件等。在用户阅读邮件时，POP命令所有的邮件信息立即下载到用户的计算机上，不在服务器上保留。 POP3(Post Office Protocol 3)即邮局协议的第3个版本,是因特网电子邮件的第一个离线协议标准。
3、IMAP协议
互联网信息访问协议（IMAP）是一种优于POP的新协议。和POP一样，IMAP也能下载邮件、从服务器中删除邮件或询问是否有新邮件，但IMAP克服了POP的一些缺点。例如，它可以决定客户机请求邮件服务器提交所收到邮件的方式，请求邮件服务器只下载所选中的邮件而不是全部邮件。客户机可先阅读邮件信息的标题和发送者的名字再决定是否下载这个邮件。通过用户的客户机电子邮件程序，IMAP可让用户在服务器上创建并管理邮件文件夹或邮箱、删除邮件、查询某封信的一部分或全部内容，完成所有这些工作时都不需要把邮件从服务器下载到用户的个人计算机上。支持种IMAP的常用邮件客户端有：ThunderMail,Foxmail,Microsoft Outlook等。
4、Exchange
Exchange是个消息与协作系统的系列产品。包括服务器产品、客户端产品等等。
Exchange Server 是一个设计完备的邮件服务器产品， 提供了通常所需要的全部邮件服务功能。除了常规的 SMTP/POP 协议服务之外，它还支持 IMAP4 、LDAP 和 NNTP 协议。Exchange Server 服务器有两种版本，标准版包括 Active Server、网络新闻服务和一系列与其他邮件系统的接口；企业版除了包括标准版的功能外，还包括与 IBM OfficeVision、X.400、VM 和 SNADS 通信的电子邮件网关，Exchange Server 支持基于Web 浏览器的邮件访问。
Microsoft Exchange Online 是一个电子邮件、日程和联系人云解决方案。它提供和Microsoft Exchange Server相同的技术方案。
Microsoft Exchange Server使用RPC protocol, MAPI/RPC（Microsoft Outlook client） ，支持Exchange ActiveSync（安全和 Exchange server同步邮件、联系人和其它数据），支持ActiveSync push e-mail, 这些功能已经使用到iPhone和Android 等设备。