如果页面中不用Ajax，cs中运行某段js代码方式可以是：
Page.ClientScript.RegisterStartupScript(Page.GetType(), "", "<script>window.open(‘default2.aspx‘)</script>");
如果页面中使用了Ajax ,则上述代码即使执行也无效果。对这种情况我们通常采用：
ScriptManager.RegisterStartupScript(this.Button1, this.GetType(), "alertScript", "window.open(‘default2.aspx‘);", true);
其中第一个参数为要注册脚本的控件ID，试了一下，只要是本页面的就行。
第二个参数为注册脚本控件类型，是控件还是this的GetType（）都可以，typeOf(string)也没问题.
第三个脚本函数的名字，随便起。
第四个是脚本内容。
第五个是标明是否再添加脚本标签，如果第四个参数里包含了<script></script>标签，此处则为false，否则为true。
注意：aspx代码是这样的
<div>
<asp:UpdatePanel ID="UpdatePanel1" runat="server">
<ContentTemplate>
<asp:TextBox runat="server" ID="TextBox2" >
</asp:TextBox>
<asp:Button runat="server" Text="Button" ID="Button1" onClick="Button1_Click" />
</ContentTemplate>
<Triggers>
<asp:PostBackTrigger ControlID="Button1" />
</Triggers>
</asp:UpdatePanel>
</div>
我在Button1_Click的事件里注册脚本，一定要加红色的部分，否则总是提示不能parse什么东西！
另外，js无法干涉cs代码。所以一旦脚本注册成功，js和cs代码会互不相干的各自运行。
以上的内容来自别人的文章，现在说一下自己的使用体会：在按钮Button1的onClick事件中注册脚本可以这样写：ScriptManager.RegisterStartupScript(this.UpdatePanel1, Page.GetType(), System.DateTime.Now.Ticks.ToString(), "window.open(‘default2.aspx‘);", true);页面中的红色部分也可以去掉了。现在对第三个参数“脚本函数的名称”要特别说明一下，
如果在onClick事件中，使用该方法注册了两个脚本。如果注册的两个脚本函数的名称相同，则第二个脚本函数就不会执行。因为脚本管理器使用此字符串来分析是否是一个已经加载过的脚本，如果加载过，将不会再次渲染。所以第二个就不会加载执行了。