python学习——读取染色体长度（二、向前一步：通过染色体序列获得长度信息）

# 读取fasta

# 解析每条序列的长度

chr1_seq = ‘ATATATATAT‘

chr2_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCG‘

chr3_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT‘

chr4_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG‘

chr5_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT‘

# 求和

total_len = len(chr1_seq) + len(chr2_seq) + len(chr3_seq) + len(chr4_seq) + len(chr5_seq)

# 输出结果

print(total_len)

原文地址：https://www.cnblogs.com/caicai2019/p/10784026.html

时间： 2024-10-11 09:37:56

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# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = {'chr1':10,'chr2':20,'chr3':30,'chr4':40,'chr5':15} # 求和 total_len = sum(chr_len.values()) # 求最长染色体编号 max_chr ='' max_len = 0 for [chr,len] in chr_len.items(): if len > max_len: print('current chr > max chr') max_chr

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