本文转自：http://blog.csdn.net/zmzsoftware/article/details/6835604
MySQL第二天早上第一次连接超时报错，解决方法com.mysql.jdbc.exceptions.jdbc4.CommunicationsException: Communications link failure
com.mysql.jdbc.exceptions.jdbc4.CommunicationsException: Communications link failure Last packet sent to the server was 0 ms ago
最近碰到一个mysql5数据库的问题。就是一个标准的servlet/tomcat网络应用，后台使用mysql数据库。问题是待机一晚上后，第二天早上第一次登录总是失败。察看日志发现如下错误：
“com.mysql.jdbc.exceptions.jdbc4.CommunicationsException: Communications link failure
Last packet sent to the server was 0 ms ago.”
经过一番调研，发现很多人都碰到过类似问题，但网上令人满意的回答并不多。mysql网站上的提问也很多，但并没有正确答案；百度知道上倒是有一个近似正确的回答。现将本人的解决办法总结一下：
上述问题是由mysql5数据库的配置引起的。mysql5将其连接的等待时间(wait_timeout)缺省为8小时。在其客户程序中可以这样来查看其值：
mysql﹥
mysql﹥ show global variables like ‘wait_timeout‘;
+---------------+---------+
| Variable_name | Value |
+---------------+---------+
| wait_timeout | 28800 |
+---------------+---------+
1 row in set (0.00 sec)
28800 seconds，也就是8小时。
如果在wait_timeout秒期间内，数据库连接(java.sql.Connection)一直处于等待状态，mysql5就将该连接关闭。这时，你的Java应用的连接池仍然合法地持有该连接的引用。当用该连接来进行数据库操作时，就碰到上述错误。这解释了为什么我的程序第二天不能登录 的问题。
你可能会想到在tomcat的数据源配置中有没有办法解决？的确，在jdbc连接url的配置中，你可以附上“autoReconnect=true”，但这仅对mysql5以前的版本起作用。增加“validation query”似乎也无济于事。
本人觉得最简单的办法，就是对症下药：既然问题是由mysql5的全局变量wait_timeout的缺省值太小引起的，我们将其改大就好了。
查看mysql5的手册，发现对wait_timeout的最大值分别是24天/365天(windows/linux)。以windows为 例，假设我们要将其设为21天，我们只要修改mysql5的配置文件“my.ini”(mysql5 installation dir)，增加一行：wait_timeout=1814400
需要重新启动mysql5。
linux系统配置文件：/etc/my.cnf
测试显示问题解决了。