生物信息的工具和数据库太多,但有一些基础的工具是必须精通的,甚至需要经常翻阅寻找灵感。
通用数据库:
UCSC Genome Browser - 基因组的可视化
OMIM- Online Mendelian Inheritance in Man - 研究疾病必备
专业数据库汇总:
遗传数据库
表观数据库
蛋白数据库: UniProt, PDB, Pfam, CATH, SCOP2
代谢物数据库
待整理:
GeneMANIA - gene network, 分析碰到瓶颈了就去里面找找证据。
webgestalt - 无需编程,网络版的GO、KEGG和GSEA分析工具
TCGA
GTEx
GEO
ENCODE
SRA
gnomAD
ARCHS4
clinvar
NONCODE
GO
KEGG
dbSNP
STRING
NCBI
GWASdb
omictools - 汇总数据库 收费了
我的final model需要整合这些数据库!!!
长期收集。。。
原文地址:https://www.cnblogs.com/leezx/p/10842139.html
时间: 2024-10-10 22:21:32